RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 SFRP1Q8N474 314 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TRPV3Q8NET8 790 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CHD5Q8TDI0 1954 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 A8MX80 341 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CD160O95971 181 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CHEK2O96017 543 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SLC10A3P09131 477 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 PCNAP12004 261 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 IL27RAQ6UWB1 636 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 GLT1D1Q96MS3 346 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CASD1Q96PB1 797 aa25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.631e-10■■■■■ 39.4
RAB40C-201ENST00000248139 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TCRBV5S2A0A599 114 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CDK4P11802 303 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ALDH3B2P48448 385 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM199Q8N511 208 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 OR56A4Q8NGH8 313 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 METTL6Q8TCB7 284 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 VPS50Q96JG6 964 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SPATA17Q96L03 361 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM161AQ9NX61 479 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 PADI4Q9UM07 663 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 GBF1Q92538 1859 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TMCC1O94876 653 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 G6PDP11413 515 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 HRH2P25021 359 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 GGT5P36269 586 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CTBSQ01459 385 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SEMG2Q02383 582 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TCTN1Q2MV58 587 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 OTUD3Q5T2D3 398 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 OGFOD2Q6N063 350 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SPATA19Q7Z5L4 167 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CLDN19Q8N6F1 224 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RNF145Q96MT1 663 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 BOCQ9BWV1 1114 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 EBF1Q9UH73 591 aa25.25■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 C2orf78A6NCI8 922 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CA12O43570 354 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 STC2O76061 302 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SNAP29O95721 258 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 OR1D2P34982 312 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 GDF5P43026 501 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 NKX3-2P78367 333 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RNF180Q86T96 592 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 BIRC7Q96CA5 298 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TM6SF2Q9BZW4 377 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 K7ERQ8 282 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 NBNO60934 754 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ATP6AP1Q15904 470 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TRIM54Q9BYV2 358 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SUN2Q9UH99 717 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RIMKLBQ9ULI2 386 aa25.24■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 GKP32189 559 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ERVK-8P63133 956 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 FBXO22Q8NEZ5 403 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF840PA6NDX5 716 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 STX16O14662 325 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 EEDO75530 441 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 MLYCDO95822 493 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TTPAP49638 278 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 FAM151BQ6UXP7 276 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 SLC8A2Q9UPR5 921 aa25.23■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ANKRD33BA6NCL7 494 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 FFAR3O14843 346 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 GPR42O15529 346 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 KLK8O60259 260 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 RFC2P35250 354 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 TTC30BQ8N4P2 665 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 MFSD2AQ8NA29 543 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 OR4F6Q8NGB9 312 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ACTL8Q9H568 366 aa25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
RAB40C-201ENST00000248139 ANAPC2Q9UJX6 822 aa25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.7 ms