RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000040877.1

TARBP1-201, Transcript of TAR (HIV-1) RNA binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TARBP1, Length 5,130 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARBP1-201ENST00000040877 HIPK1Q86Z02 1210 aa22.94■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 SCAMP5Q8TAC9 235 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 PTGFRNQ9P2B2 879 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 LRRC37A3O60309 1634 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 RFC2P35250 354 aa22.94■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 SNX20Q7Z614 316 aa22.94■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 F2P00734 622 aa22.94■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 HSD17B2P37059 387 aa22.94■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 PI15O43692 258 aa22.93■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 ACTR3P61158 418 aa22.93■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 OR2T34Q8NGX1 318 aa22.93■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 OR2T3Q8NH03 318 aa22.93■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 ROPN1LQ96C74 230 aa22.93■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 SCLYQ96I15 445 aa22.93■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 C8orf48Q96LL4 319 aa22.93■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 ABCB8Q9NUT2 735 aa22.93■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 KRT33AO76009 404 aa22.93■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 AKT2P31751 481 aa22.92■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 MAPK12P53778 367 aa22.92■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 VITQ6UXI7 678 aa22.92■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 ELOVL7A1L3X0 281 aa22.92■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 ZNF792Q3KQV3 632 aa22.92■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 OLR1P78380 273 aa22.92■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 MSANTD2Q6P1R3 559 aa22.92■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 TMEM192Q8IY95 271 aa22.92■■□□□ 1.26
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TARBP1-201ENST00000040877 TMEM27Q9HBJ8 222 aa22.92■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 MCIDASD6RGH6 385 aa22.91■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 SLC22A2O15244 555 aa22.91■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 SCN2BO60939 215 aa22.91■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 SCELO95171 688 aa22.91■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 RCVRNP35243 200 aa22.91■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 HEPACAMQ14CZ8 416 aa22.91■■□□□ 1.26
TARBP1-201ENST00000040877 UBXN11Q5T124 520 aa22.91■■□□□ 1.26
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