RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000038514.14

Nup54-201, Transcript of Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nup54, Length 2,352 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54-201ENSMUST00000038514 Znf24Q91VN1 368 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 MpstQ99J99 297 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 MmadhcQ99LS1 296 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Snx2Q9CWK8 519 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kdm8Q9CXT6 414 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ubqln5Q9D4I8 510 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 LrgukQ9D5S7 820 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hipk3Q9ERH7 1192 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ifi30Q9ESY9 248 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 PrebQ9WUQ2 417 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Katna1Q9WV86 491 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Scn8aQ9WTU3 1978 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pcm1Q9R0L6 2025 aa14.85□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Spin2gA0A0N4SW15 236 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Lcn6A2AJB9 181 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Krt83E9Q1Y9 479 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Spin2eJ3QNQ0 234 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sec22bO08547 215 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sdc4O35988 198 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 NfkbieO54910 364 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hoxa9P09631 271 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Clec2lP0C7M9 211 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 WarsP32921 481 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Brsk1Q5RJI5 778 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ifit3Q64345 403 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Psapl1Q8C1C1 522 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Tmc7Q8C428 726 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ifi205aQ8CGE8 404 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Nox1Q8CIZ9 591 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 BroxQ8K2Q7 411 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zdhhc12Q8VC90 267 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 KelQ9EQF2 713 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Snap29Q9ERB0 260 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pias4Q9JM05 507 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr625-ps1A0A140T8L4 321 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 RfngO09009 332 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Kpna6O35345 536 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fv4P11370 679 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cbx3P23198 183 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cd300lgQ1ERP8 331 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 DtlQ3TLR7 729 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pnpla1Q3V1D5 599 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rnf215Q5SPX3 379 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pex26Q8BGI5 305 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Morc4Q8BMD7 928 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Vrk2Q8BN21 503 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Chst8Q8BQ86 417 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hid1Q8R1F6 788 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr617Q8VGA1 318 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 TraipQ8VIG6 470 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 TmlheQ91ZE0 421 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Oas1cQ924S2 362 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pwp1Q99LL5 501 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cmc1Q9CPZ8 106 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zcchc12Q9CZA5 402 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Cnbd2Q9D5U8 673 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Aldh1a3Q9JHW9 512 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Plscr1Q9JJ00 328 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 B9d1Q9R1S0 204 aa14.84□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm8369E9PZI3 166 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Alkal1J3QPP8 127 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Vmn2r54K7N649 806 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 PuraP42669 321 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Smim24Q0VG18 120 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gpatch4Q3TFK5 415 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Krt2Q3TTY5 707 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ppm1hQ3UYC0 513 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Gm5800Q497L3 186 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Bhlha9Q5RJB0 231 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 NkaplQ5SZT7 395 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mxd4Q60948 209 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Rbbp7Q60973 425 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 ManealQ6P1J0 452 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Zmpste24Q80W54 475 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 LdahQ8BVA5 326 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Atg10Q8R1P4 215 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 FktnQ8R507 461 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 RhoqQ8R527 205 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 OscarQ8VBT3 265 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Olfr677Q8VF06 312 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Mcm8Q9CWV1 833 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Hm13Q9D8V0 378 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Apbb2Q9DBR4 760 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 IgtpQ9DCE9 423 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Znhit2Q9QY66 399 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 M1apQ9Z0E1 529 aa14.83□□□□□ -0.03
Nup54-201ENSMUST00000038514 Arrdc4A0A0B4J1F4 415 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 A6H6Q4 206 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 TriqkB2B9E1 86 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Pbx3O35317 434 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Btnl2O70355 454 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 ThrbP37242 461 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Slc19a1P41438 512 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Fubp3Q3TIX6 575 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 CenplQ3U3S3 329 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Sh2d1b2Q45HK4 132 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 VwdeQ6DFV8 926 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 SyncripQ7TMK9 623 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Tmem220Q8BP07 167 aa14.83□□□□□ -0.04
Nup54-201ENSMUST00000038514 Ccdc17Q8CE13 565 aa14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.6 ms