RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM135	Q86UB9	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	C4orf19	Q8IY42	314 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	FBXL16	Q8N461	479 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PRR18	Q8N4B5	295 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	BOLL	Q8N9W6	283 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T34	Q8NGX1	318 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	POC1B	Q8TC44	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CENPT	Q96BT3	561 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC43	Q96MW1	224 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KLF2	Q9Y5W3	355 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SCN1A	P35498	2009 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768		A0A1W2PQM1	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	C19orf84	I3L1E1	186 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	F2RL2	O00254	374 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NPC1	O15118	1278 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MID1	O15344	667 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KCNN4	O15554	427 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB43	O43298	467 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	COCH	O43405	550 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	REC8	O95072	547 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	HEXA	P06865	529 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LRPAP1	P30533	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCKBR	P32239	447 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TRAPPC10	P48553	1259 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCR5	P51681	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PGD	P52209	483 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LILRA4	P59901	499 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MYL7	Q01449	175 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SMARCB1	Q12824	385 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	KRT32	Q14532	448 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NPY5R	Q15761	445 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF776	Q68DI1	518 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	LINGO4	Q6UY18	593 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RUFY3	Q7L099	469 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	METTL23	Q86XA0	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TPH2	Q8IWU9	490 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MIER2	Q8N344	545 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TM6SF1	Q9BZW5	370 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SIK2	Q9H0K1	926 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CDH19	Q9H159	772 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	C2orf40	Q9H1Z8	148 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	GPR35	Q9HC97	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	POLD4	Q9HCU8	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	C6orf50	Q9HD87	102 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CHST11	Q9NPF2	352 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PRSS16	Q9NQE7	514 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ELOVL2	Q9NXB9	296 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	BARHL2	Q9NY43	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	WDR35	Q9P2L0	1181 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	UNC13C	Q8NB66	2214 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768		A6NCN8	305 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	MASP2	O00187	686 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CYB561D2	O14569	222 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	HCRT	O43612	131 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CXCL8	P10145	99 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	GATA3	P23771	443 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	RCAN1	P53805	252 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	TSPY1	Q01534	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CHAF1B	Q13112	559 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PDIA5	Q14554	519 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	C16orf72	Q14CZ0	275 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	CEBPE	Q15744	281 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF630	Q2M218	657 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	PARS2	Q7L3T8	475 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MLH1-223	ENST00000616768	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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