RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612229.4

PTPRT-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 11,285 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-209ENST00000612229 BTBD19C9JJ37 291 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CSF1RP07333 972 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CYP3A4P08684 503 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CLK2P49760 499 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TPTEP56180 551 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 EFEMP1Q12805 493 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 UBXN11Q5T124 520 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PBDC1Q9BVG4 233 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BTBD2Q9BX70 525 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 YES1P07947 543 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TAS2R43P59537 309 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PRR5P85299 388 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ST3GAL4Q11206 333 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RAB39AQ14964 217 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TRAM1Q15629 374 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM94Q12767 1356 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PIK3C2BO00750 1634 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NR2F1P10589 423 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NODALQ96S42 347 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 TMEM184CQ9NVA4 438 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HPF1Q9NWY4 346 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 KCNN3Q9UGI6 736 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 USP20Q9Y2K6 914 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MYOM1P52179 1685 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CATP04040 527 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HGFP14210 728 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC6A4P31645 630 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PTPN5P54829 565 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM71AQ8IYT1 594 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ROBO3Q96MS0 1386 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AIPO00170 330 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CBX4O00257 560 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 AZIN1O14977 448 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CYP4B1P13584 511 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GADD45AP24522 165 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 GNMTQ14749 295 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SATL1Q86VE3 508 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ELOVL4Q9GZR5 314 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SOHLH2Q9NX45 425 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ERCC6L2Q5T890 1561 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 COL6A2P12110 1019 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 MARSP56192 900 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GPAT3Q53EU6 434 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM46CQ5VWP2 391 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FBXO33Q7Z6M2 555 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 FAM83DQ9H4H8 585 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 NUDT15Q9NV35 164 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SCN8AQ9UQD0 1980 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 B3GAT3O94766 335 aa6.93□□□□□ -1.3
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PTPRT-209ENST00000612229 CTSKP43235 329 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SNAPC1Q16533 368 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 DPY19L1Q2PZI1 675 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 COLEC12Q5KU26 742 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 LRIF1Q5T3J3 769 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 CXorf21Q9HAI6 301 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZFP57Q9NU63 452 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 PSMB4P28070 264 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZZZ3Q8IYH5 903 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-209ENST00000612229 ZNF347Q96SE7 839 aa6.93□□□□□ -1.3
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