RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NENF	Q9UMX5	172 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF711	Q9Y462	761 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MED13	Q9UHV7	2174 aa		11.75	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BLACE	A4D250	179 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC14C	A4D256	554 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO1F	O00160	1098 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TOX3	O15405	576 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RASSF9	O75901	435 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	VIP	P01282	170 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KRT7	P08729	469 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FGF5	P12034	268 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PBX1	P40424	430 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PMS2	P54278	862 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PPID	Q08752	370 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NR1I3	Q14994	352 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	HADH	Q16836	314 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RASGRP3	Q8IV61	690 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KCTD6	Q8NC69	237 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CCNY	Q8ND76	341 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CT55	Q8WUE5	264 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TLK1	Q9UKI8	766 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	POLH	Q9Y253	713 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		11.74	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPE	Q02224	2701 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AURKA	O14965	403 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KATNA1	O75449	491 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SPAG6	O75602	509 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RFPL1	O75677	317 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PROSC	O94903	275 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NTRK1	P04629	796 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPING1	P05155	500 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR89B	P0CG08	455 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	BPI	P17213	487 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AMD1	P17707	334 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	MX2	P20592	715 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NOP2	P46087	812 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	DNASE1L3	Q13609	305 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	IL11RA	Q14626	422 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNAB1	Q14722	419 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PDK2	Q15119	407 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PCSK7	Q16549	785 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CPZ	Q66K79	652 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CERS6	Q6ZMG9	384 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR150	Q8NGU9	434 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RAPGEF5	Q92565	580 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TADA1	Q96BN2	335 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GBP4	Q96PP9	640 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PACSIN1	Q9BY11	444 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TWSG1	Q9GZX9	223 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHB3	Q9Y5E6	796 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		11.73	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	ITPR2	Q14571	2701 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	KMO	O15229	486 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR39	O43194	453 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	CREG1	O75629	220 aa		11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	NELFE	P18615	380 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.72	□□□□□ -0.53
TTLL3-233	ENST00000602338	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.72	□□□□□ -0.53

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