RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 A0A1W2PQJ5 194 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KATNA1O75449 491 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RASSF9O75901 435 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPZBP47756 277 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 IL11RAQ14626 422 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PRSS42Q7Z5A4 293 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TMC3Q7Z5M5 1100 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 LRRTM4Q86VH4 590 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM26EQ8N5C1 309 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 POT1Q9NUX5 634 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF711Q9Y462 761 aa25.23■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 OR52A4PA6NMU1 304 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L22H0YM25 854 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KMOO15229 486 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RPL10P27635 214 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TCTN3Q6NUS6 607 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RAPGEF5Q92565 580 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMM29Q9BSF4 260 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEE1Q9HCI5 957 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC40A1Q9NP59 571 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 NENFQ9UMX5 172 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 POLHQ9Y253 713 aa25.22■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 SPAG6O75602 509 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FGF5P12034 268 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PBX1P40424 430 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CD97P48960 835 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 DRG2P55039 364 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 MLLT10P55197 1068 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR18Q14330 331 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 IQCB1Q15051 598 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CACHD1Q5VU97 1274 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PDPK2PQ6A1A2 396 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 FAM92BQ6ZTR7 304 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 PLD5Q8N7P1 536 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL6Q8WZ60 621 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 RNF157Q96PX1 679 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa25.21■■□□□ 1.63
CAPNS1-211ENST00000590874 CDC14CA4D256 554 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TIAF1O95411 115 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NTRK1P04629 796 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 KRT7P08729 469 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 BPIP17213 487 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PCSK7Q16549 785 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ASB18Q6ZVZ8 466 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TEX19Q8NA77 164 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CPLX3Q8WVH0 158 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RAD18Q9NS91 495 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.2■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 VEGFDO43915 354 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 RFPL1O75677 317 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CDK14O94921 469 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 KDELR1P24390 212 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1CAP62136 330 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZBED6P86452 979 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 DNASE1L3Q13609 305 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 IRGCQ6NXR0 463 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf96Q7Z7L8 435 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TADA1Q96BN2 335 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP3Q96P47 875 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TWSG1Q9GZX9 223 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 KCND3Q9UK17 655 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 TLK1Q9UKI8 766 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR37Q9Y2I8 494 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 HEY1Q9Y5J3 304 aa25.19■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 AURKAO14965 403 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CREG1O75629 220 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PDGFAP04085 211 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PMS2P54278 862 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 AP1B1Q10567 949 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 WASH2PQ6VEQ5 465 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 NT5DC3Q86UY8 548 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PPP1R3BQ86XI6 285 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CT55Q8WUE5 264 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf40BQ96DE9 158 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 PACSIN1Q9BY11 444 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 LHX9Q9NQ69 397 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 WASH6PQ9NQA3 447 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 UVRAGQ9P2Y5 699 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 EPHA6Q9UF33 1036 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 CAPN11Q9UMQ6 739 aa25.18■■□□□ 1.62
CAPNS1-211ENST00000590874 SPO11Q9Y5K1 396 aa25.18■■□□□ 1.62
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