RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	IRX4	P78413	519 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PDE1B	Q01064	536 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DEUP1	Q05D60	604 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	WASHC5	Q12768	1159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STX3	Q13277	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	LAMB3	Q13751	1172 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC1A5	Q15758	541 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	UGP2	Q16851	508 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CDO1	Q16878	200 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DNAL1	Q4LDG9	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DCAF6	Q58WW2	860 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STEAP4	Q687X5	459 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM47E	Q6ZV65	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP4V2	Q6ZWL3	525 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TTC30A	Q86WT1	665 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CDR2L	Q86X02	465 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC44A3	Q8N4M1	653 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C12orf29	Q8N999	325 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC2A14	Q8TDB8	520 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	STON2	Q8WXE9	905 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OLFM3	Q96PB7	478 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC2A13	Q96QE2	648 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PEBP4	Q96S96	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	NPY6R	Q99463	290 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CPNE1	Q99829	537 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MED10	Q9BTT4	135 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TRPV6	Q9H1D0	765 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM74B	Q9NUR3	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HACD3	Q9P035	362 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PIN4	Q9Y237	131 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SQOR	Q9Y6N5	450 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EP400	Q96L91	3159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PLXNB2	O15031	1838 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289		M0QYT0	321 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	EEF2K	O00418	725 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP11	O75319	330 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CSDE1	O75534	798 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	RFPL1	O75677	317 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GRAP2	O75791	330 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ANXA9	O76027	345 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HAUS5	O94927	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ANP32D	O95626	131 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	BPGM	P07738	259 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ODC1	P11926	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AKR1A1	P14550	325 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GCSH	P23434	173 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNC	P24863	283 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ADRA1D	P25100	572 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	ADORA2B	P29275	332 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXC8	P31273	242 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	GP5	P40197	560 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MPL	P40238	635 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	IL12RB1	P42701	662 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SULT1E1	P49888	294 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC5A3	P53794	718 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MRPS6	P82932	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TMPRSS15	P98073	1019 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	OCA2	Q04671	838 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	AP1B1	Q10567	949 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	MALL	Q13021	153 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF5	Q15542	800 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
PTPRM-215	ENST00000583289	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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