RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SLC40A1	Q9NP59	571 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	POT1	Q9NUX5	634 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RBM22	Q9NW64	420 aa	Known RBP eCLIP	11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DTL	Q9NZJ0	730 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SEMA5B	Q9P283	1151 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		11.2	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SVIL	O95425	2214 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ANKRD66	B4E2M5	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MFSD11	O43934	449 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DDAH2	O95865	285 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	BRAF	P15056	766 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PTPN4	P29074	926 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CAPZB	P47756	277 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF165	P49910	485 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	LAMB3	Q13751	1172 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF571	Q7Z3V5	609 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FAM71B	Q8TC56	605 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	EID2B	Q96D98	161 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PDE7B	Q9NP56	450 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ARFGAP3	Q9NP61	516 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.19	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169		A1L4Q6	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	LRRC53	A6NM62	1247 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PDZK1P1	A8MUH7	402 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	KMO	O15229	486 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MTA2	O94776	668 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	HLA-DQB2	P05538	268 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MYBL1	P10243	752 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FOLR1	P15328	257 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CCNC	P24863	283 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PRKCI	P41743	596 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	DCDC1	P59894	354 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MYL5	Q02045	173 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SLC25A11	Q02978	314 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MMRN1	Q13201	1228 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	GPR18	Q14330	331 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	IFI16	Q16666	785 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	INSC	Q1MX18	579 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC122	Q5T0U0	273 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CPZ	Q66K79	652 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	IRGC	Q6NXR0	463 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SYVN1	Q86TM6	617 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	BPHL	Q86WA6	291 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	GPR26	Q8NDV2	337 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TRIM11	Q96F44	468 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ISCU	Q9H1K1	167 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	AIPL1	Q9NZN9	384 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RARRES3	Q9UL19	164 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		11.18	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	IGHV5-51	A0A0C4DH38	117 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	WIPF3	A6NGB9	483 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	VEGFD	O43915	354 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CEACAM4	O75871	244 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	MMP2	P08253	660 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CD48	P09326	243 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CCL11	P51671	97 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	ARSE	P51690	589 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	PPP1CA	P62136	330 aa		11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	RPS15	P62841	145 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
TCF4-238	ENST00000568169	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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