RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565975.5

SPNS1-207, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 1,979 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-207ENST00000565975 MYO19Q96H55 970 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 PGLSO95336 258 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ATP6V1B2P21281 511 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.138e-7■■■■■ 26.9
SPNS1-207ENST00000565975 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 DIO3P55073 304 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ERVK-8P63133 956 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 RAB33AQ14088 237 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 TGFBIQ15582 683 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ANKFN1Q8N957 763 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 SMPD4Q9NXE4 827 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ZIM2Q9NZV7 527 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 SLC6A2P23975 617 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 CSKP41240 450 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 KCNK10P57789 538 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 IKBKEQ14164 716 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ARHGEF6Q15052 776 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.132e-12■■■■■ 47.2
SPNS1-207ENST00000565975 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 Q6ZNB5 142 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 FAM217AQ8IXS0 508 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 NCSTNQ92542 709 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 LRCH3Q96II8 777 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 CNBD2Q96M20 576 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 HIPK3Q9H422 1215 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 COQ10BQ9H8M1 238 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 CMTM6Q9NX76 183 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 ACTR3BQ9P1U1 418 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS1-207ENST00000565975 GREM1O60565 184 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 EEDO75530 441 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 FAM58BPP0C7Q3 252 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 BMP2P12643 396 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 CCL23P55773 120 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 INPP5AQ14642 412 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PTPRRQ15256 657 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 CNPY1Q3B7I2 92 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PITRM1Q5JRX3 1037 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 C6orf52Q5T4I8 152 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ERMP1Q7Z2K6 904 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PIH1D2Q8WWB5 315 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ABHD8Q96I13 439 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SNX13Q9Y5W8 968 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SCN5AQ14524 2016 aa22.08■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF839A8K0R7 811 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 OLFM2O95897 454 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 GRIA3P42263 894 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 HMBOX1Q6NT76 420 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 IL1RL2Q9HB29 575 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PADI4Q9UM07 663 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ST14Q9Y5Y6 855 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 GRXCR2A6NFK2 248 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SLC22A3O75751 556 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 MAPK8P45983 427 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 CSNK1DP48730 415 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 EPHB3P54753 998 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 MYBPC1Q00872 1141 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 CDH18Q13634 790 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 MTX3Q5HYI7 312 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SLC39A11Q8N1S5 342 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 EID2BQ96D98 161 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 DYTNA2CJ06 578 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 PRRG1O14668 218 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 OR4F21O95013 312 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS1-207ENST00000565975 RPL5P46777 297 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
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