RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554811.5

XRCC3-208, Transcript of X-ray repair cross complementing 3, human

TSL 2

Gene XRCC3, Length 3,668 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
XRCC3-208	ENST00000554811	PELI3	Q8N2H9	469 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	OR56A4	Q8NGH8	313 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ISOC1	Q96CN7	298 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	FBXO44	Q9H4M3	255 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SMPD3	Q9NY59	655 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ARVCF	O00192	962 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TACR2	P21452	398 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	MTHFR	P42898	656 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	HK2	P52789	917 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RHOA	P61586	193 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PRKG2	Q13237	762 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SPIDR	Q14159	915 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	MSANTD2	Q6P1R3	559 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	VPS45	Q9NRW7	570 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PSME4	Q14997	1843 aa		11.75	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	FKBP9	O95302	570 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	DNAJB13	P59910	316 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	FKBP9P1	Q75LS8	142 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PYCR2	Q96C36	320 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	BIRC7	Q96CA5	298 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NSUN3	Q9H649	340 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RMI1	Q9H9A7	625 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	BAG5	Q9UL15	447 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PARP14	Q460N5	1801 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	CST1	P01037	141 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	FGF1	P05230	155 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	AQP1	P29972	269 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	FLT3LG	P49771	235 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	C21orf59	P57076	290 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SELPLG	Q14242	412 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	MYOC	Q99972	504 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TRMO	Q9BU70	441 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	BDH2	Q9BUT1	245 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NANOG	Q9H9S0	305 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	DNAAF2	Q9NVR5	837 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TMEM181	Q9P2C4	612 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TMCO1	Q9UM00	188 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TRIM24	O15164	1050 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	GJB5	O95377	273 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PKM	P14618	531 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	STC1	P52823	247 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PLD1	Q13393	1074 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RFTN1	Q14699	578 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	GTDC1	Q4AE62	458 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	GALNT18	Q6P9A2	607 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ASIC4	Q96FT7	647 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ZNF597	Q96LX8	424 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	DPY30	Q9C005	99 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	CLPB	Q9H078	707 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	IFT80	Q9P2H3	777 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PNMA8B	Q9ULN7	279 aa	Predicted RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ZFC3H1	O60293	1989 aa	Known RBP	11.74	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	BPTF	Q12830	3046 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	DFNA5	O60443	496 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ATE1	O95260	518 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NDST3	O95803	873 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ADRM1	Q16186	407 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	GAB3	Q8WWW8	586 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	NRBF2	Q96F24	287 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	IPPK	Q9H8X2	491 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	ACTR8	Q9H981	624 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	SEPT3	Q9UH03	358 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	XYLB	O75191	536 aa		11.73	□□□□□ -0.53
XRCC3-208	ENST00000554811	CAPN15	O75808	1086 aa		11.73	□□□□□ -0.53

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms