RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	C1orf54	Q8WWF1	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TEKT5	Q96M29	485 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	WDR92	Q96MX6	357 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	VAT1	Q99536	393 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TRIM55	Q9BYV6	548 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CEP41	Q9BYV8	373 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	NOD2	Q9HC29	1040 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	SAR1B	Q9Y6B6	198 aa		13.71	□□□□□ -0.21
CS-231	ENST00000552222	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PGRMC1	O00264	195 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KCNN4	O15554	427 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	FGF1	P05230	155 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PNLIP	P16233	465 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TCN2	P20062	427 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CES1	P23141	567 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CASQ1	P31415	396 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	LIMK2	P53671	638 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NIPAL4	Q0D2K0	466 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	IHH	Q14623	411 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZNF567	Q8N184	647 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PRELID2	Q8N945	189 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GALNT11	Q8NCW6	608 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NLGN4Y	Q8NFZ3	816 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	RAB7B	Q96AH8	199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	AGAP3	Q96P47	875 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ATP13A3	Q9H7F0	1226 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		13.7	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	LOC107983988	A0A1B0GUW6	1196 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222		A8MX80	341 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TRAFD1	O14545	582 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SOCS5	O75159	536 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	MMP2	P08253	660 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	THRA	P10827	490 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZNF28	P17035	718 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	HTR1B	P28222	390 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SERPINA4	P29622	427 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DSC2	Q02487	901 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	BCL2L1	Q07817	233 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ITK	Q08881	620 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CREG2	Q8IUH2	290 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DDA1	Q9BW61	102 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	B3GNT4	Q9C0J1	378 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SUV39H2	Q9H5I1	410 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	GLOD4	Q9HC38	313 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SMARCAL1	Q9NZC9	954 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TTLL3	Q9Y4R7	772 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SHANK1	Q9Y566	2161 aa		13.69	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TSPAN11	A1L157	253 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	C5orf60	A6NFR6	353 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	LIG3	P49916	1009 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	CHAF1B	Q13112	559 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SNX1	Q13596	522 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	SEPT6	Q14141	434 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	DCAF12	Q5T6F0	453 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		13.68	□□□□□ -0.22
CS-231	ENST00000552222	PID1	Q7Z2X4	250 aa		13.68	□□□□□ -0.22

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