RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	MMP2	P08253	660 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	CHRNB2	P17787	502 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	KEL	P23276	732 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	RRM1	P23921	792 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	SHMT1	P34896	483 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	UBA7	P41226	1012 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	CAMP	P49913	170 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	MFAP4	P55083	255 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	IFI35	P80217	286 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	TFAP4	Q01664	338 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	MTX1	Q13505	466 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	PKP1	Q13835	747 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	BECN1	Q14457	450 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	NEDD9	Q14511	834 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	MANEA	Q5SRI9	462 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA0930	Q6ICG6	404 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF280D	Q6N043	979 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	POC5	Q8NA72	575 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	KDM1B	Q8NB78	822 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	BEST2	Q8NFU1	509 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	DEFB118	Q96PH6	123 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	TRMO	Q9BU70	441 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	PLSCR4	Q9NRQ2	329 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	CYSLTR2	Q9NS75	346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	FBXL17	Q9UF56	701 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	HTT	P42858	3142 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		4.16	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.15	□□□□□ -1.74
MDM2-223	ENST00000536089		A8MZ25	164 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089		E5RJQ4	531 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	TAF4	O00268	1085 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	TLX3	O43711	291 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	OR2C1	O95371	312 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	KLKB1	P03952	638 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	DNTT	P04053	509 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	GABRB1	P18505	474 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	MYF6	P23409	242 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SLC15A1	P46059	708 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	GYG1	P46976	350 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	NRIP1	P48552	1158 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	CXCR3	P49682	368 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	ENTPD1	P49961	510 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	CLCN3	P51790	818 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	ACSM2A	Q08AH3	577 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	FAM27E3	Q08E93	113 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	IRF3	Q14653	427 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM266	Q2M3C6	531 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	USP41	Q3LFD5	358 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089		Q4G0T1	1027 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	ACSM2B	Q68CK6	577 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SLC35F3	Q8IY50	421 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	RBFA	Q8N0V3	343 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM199	Q8N511	208 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	APPL2	Q8NEU8	664 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	LPAR1	Q92633	364 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	CCDC34	Q96HJ3	373 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SERINC2	Q96SA4	455 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	TEX12	Q9BXU0	123 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	ISCU	Q9H1K1	167 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	NDST4	Q9H3R1	872 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	PLK3	Q9H4B4	646 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	PDE7B	Q9NP56	450 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	FZD3	Q9NPG1	666 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.15	□□□□□ -1.75
MDM2-223	ENST00000536089	ABI3	Q9P2A4	366 aa		4.15	□□□□□ -1.75

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