RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511396.1

APOBEC3AP1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3A pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene APOBEC3AP1, Length 287 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 TMEM150CB9EJG8 249 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ALPPP05187 535 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CTSBP07858 339 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CBSLP0DN79 551 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CAPN3P20807 821 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CBSP35520 551 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 TDGF1P3P51864 188 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 MTA1Q13330 715 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PEX6Q13608 980 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CUL4AQ13619 759 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ZNF235Q14590 738 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 C8orf34Q49A92 452 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ALS2CLQ60I27 953 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 LRRC66Q68CR7 880 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 TMEM207Q6UWW9 146 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 RAB43Q86YS6 212 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 HPS6Q86YV9 775 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 OR1L3Q8NH93 324 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 NAT14Q8WUY8 206 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SEC14L1Q92503 715 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ZNF653Q96CK0 615 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ECHDC3Q96DC8 303 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 C18orf8Q96DM3 657 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PWWP2AQ96N64 755 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 NLNQ9BYT8 704 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PDFQ9HBH1 243 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 KCND1Q9NSA2 647 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PSMD13Q9UNM6 376 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CNTN6Q9UQ52 1028 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CDYLQ9Y232 598 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 WDR37Q9Y2I8 494 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ABCA4P78363 2273 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 VPS13CQ709C8 3753 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.3□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 A0A0G2JNG1 304 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CFAP69A5D8W1 941 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 KIR2DS3K7RE56 304 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PEX12O00623 359 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PRAMEF11O60813 436 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 FAM155BO75949 473 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 KLHL18O94889 574 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SLC4A1P02730 911 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PDHA1P08559 390 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 BRAFP15056 766 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CD44P16070 742 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SYKP43405 635 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 TSFMP43897 325 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 LMAN1P49257 510 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ACY1Q03154 408 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PTSQ03393 145 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 KIR2DS5Q14953 304 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 NCF4Q15080 339 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PLCL1Q15111 1095 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ASIC2Q16515 512 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CAMK4Q16566 473 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 INSCQ1MX18 579 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 NAA35Q5VZE5 725 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 IGFL3Q6UXB1 125 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 BNIPLQ7Z465 357 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 PGBD5Q8N414 524 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 LZTR1Q8N653 840 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 BCORP1Q8N888 145 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 ZDHHC12Q96GR4 267 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 COX14Q96I36 57 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 SLC41A2Q96JW4 573 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3AP1-201ENST00000511396 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms