RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 LIMK2P53671 638 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RWDD2BP57060 319 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 GBE1Q04446 702 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PARP15Q460N3 678 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CARD16Q5EG05 197 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 LRRC73Q5JTD7 316 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SLC6A19Q695T7 634 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 NPNTQ6UXI9 565 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 LEKR1Q6ZMV7 388 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CDH24Q86UP0 819 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 MAP7D3Q8IWC1 876 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RCOR2Q8IZ40 523 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 LZTR1Q8N653 840 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TRIM58Q8NG06 486 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 LRRN4Q8WUT4 740 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TLR10Q9BXR5 811 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SLC13A1Q9BZW2 595 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TM6SF2Q9BZW4 377 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 KCND1Q9NSA2 647 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SLC39A1Q9NY26 324 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 DTLQ9NZJ0 730 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CROTQ9UKG9 612 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 GPR34Q9UPC5 381 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 POLHQ9Y253 713 aa7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 FAM221AA4D161 298 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 DFFAO00273 331 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 KRIT1O00522 736 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 APOL1O14791 398 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 FANCGO15287 622 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 LRRTM2O43300 516 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TSPAN6O43657 245 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 MAFKO60675 156 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PRAMEF11O60813 436 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 MMP20O60882 483 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CD1EP15812 388 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 BPIP17213 487 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ITIH2P19823 946 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PTPN7P35236 360 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 IGFALSP35858 605 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ETFBP38117 255 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 HK3P52790 923 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ITGA1P56199 1179 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 DYNLT1P63172 113 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 GALNT2Q10471 571 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ART3Q13508 389 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ERV3-1Q14264 604 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 NR1D2Q14995 579 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PPP2R5EQ16537 467 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ALG11Q2TAA5 492 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TFDP3Q5H9I0 405 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 FAM182AQ5T1J6 154 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RETSATQ6NUM9 610 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 MACC1Q6ZN28 852 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RD3Q7Z3Z2 195 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PIM3Q86V86 326 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RFX6Q8HWS3 928 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 HID1Q8IV36 788 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CCDC50Q8IVM0 306 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SLC35F6Q8N357 371 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ASB12Q8WXK4 309 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 OLFM3Q96PB7 478 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ALS2CR12Q96Q35 445 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CEP44Q9C0F1 390 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 DLL4Q9NR61 685 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 DOLKQ9UPQ8 538 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 NTNG1Q9Y2I2 539 aa7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 ARHGAP42A6NI28 874 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 TMEM200CA6NKL6 621 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CST8O60676 142 aa7.4□□□□□ -1.22
C9orf135-204ENST00000495399 CEACAM4O75871 244 aa7.4□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.8 ms