RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493967.1

PATJ-211, Transcript of PATJ, crumbs cell polarity complex component, humanhuman

TSL 2

Gene PATJ, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJ-211ENST00000493967 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 SEPT6Q14141 434 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 POU6F1Q14863 301 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 CCNG2Q16589 344 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 INSCQ1MX18 579 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 GPRC6AQ5T6X5 926 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 IYDQ6PHW0 289 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 USP53Q70EK8 1073 aa7.4□□□□□ -1.22
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PATJ-211ENST00000493967 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 C11orf96Q7Z7L8 435 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 REXO1L1PQ8IX06 675 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 SFRP1Q8N474 314 aa7.4□□□□□ -1.22
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PATJ-211ENST00000493967 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 ZNF398Q8TD17 642 aa7.4□□□□□ -1.22
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PATJ-211ENST00000493967 FAM96AQ9H5X1 160 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 ASB8Q9H765 288 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 RDH14Q9HBH5 336 aa7.4□□□□□ -1.22
PATJ-211ENST00000493967 EPB41L5Q9HCM4 733 aa7.4□□□□□ -1.22
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PATJ-211ENST00000493967 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 E7EVH7 732 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 PSMD3O43242 534 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 ZSCAN12O43309 604 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 CPNE6O95741 557 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 PRSS56P0CW18 603 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 F3P13726 295 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 HGFP14210 728 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 MSH3P20585 1137 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 CD1CP29017 333 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 ACTN2P35609 894 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 GRIA1P42261 906 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 FASLGP48023 281 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 LSSP48449 732 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 LMAN1P49257 510 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 MAP9Q49MG5 647 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 CCDC38Q502W7 563 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 FNBP1LQ5T0N5 605 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 PHF19Q5T6S3 580 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 TMEM220Q6QAJ8 160 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 DET1Q7L5Y6 550 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 GSTA5Q7RTV2 222 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 LINC00523Q86TU6 105 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 SLC35F6Q8N357 371 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 PRELID2Q8N945 189 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 CCDC89Q8N998 374 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 GRAMD1AQ96CP6 724 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 SGF29Q96ES7 293 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 MS4A14Q96JA4 679 aa7.39□□□□□ -1.23
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PATJ-211ENST00000493967 SLC38A3Q99624 504 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 NUDT22Q9BRQ3 303 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 TIMM29Q9BSF4 260 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 RAB6BQ9NRW1 208 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 SMOXQ9NWM0 555 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 JRKLQ9Y4A0 524 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa7.39□□□□□ -1.23
PATJ-211ENST00000493967 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.38□□□□□ -1.23
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