RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490417.6

SFXN4-208, Transcript of sideroflexin 4, human

TSL 2

Gene SFXN4, Length 952 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SFXN4-208	ENST00000490417	AGT	P01019	485 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	JMJD7	P0C870	316 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	F3	P13726	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	IDS	P22304	550 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	PSMB4	P28070	264 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FASLG	P48023	281 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM115	Q12893	351 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	NR1D2	Q14995	579 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	LONRF2	Q1L5Z9	754 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	AMZ1	Q400G9	498 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	RANBP10	Q6VN20	620 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	RAB11FIP2	Q7L804	512 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	NAGS	Q8N159	534 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SFRP1	Q8N474	314 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SARS2	Q9NP81	518 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	KLC4	Q9NSK0	619 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	DNMT3A	Q9Y6K1	912 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	CAPN6	Q9Y6Q1	641 aa		13.42	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	LRP4	O75096	1905 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417		A0A1W2PQM1	296 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	PLD2	O14939	933 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	CHUK	O15111	745 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	DUX1	O43812	170 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SNX2	O60749	519 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	KRT37	O76014	449 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	MSH3	P20585	1137 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	LMAN1	P49257	510 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	UCN	P55089	124 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SH3BP2	P78314	561 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	HHEX	Q03014	270 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	PHF19	Q5T6S3	580 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	AADACL2	Q6P093	401 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	IYD	Q6PHW0	289 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TRIM48	Q8IWZ4	208 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	RBM12B	Q8IXT5	1001 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	CCDC89	Q8N998	374 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ULK4	Q96C45	1275 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	DPH1	Q9BZG8	443 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	RP1	P56715	2156 aa		13.41	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417		E7EVH7	732 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	AURKA	O14965	403 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TNFSF15	O95150	251 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	AKT1	P31749	480 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ADRA1A	P35348	466 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FDFT1	P37268	417 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	HAL	P42357	657 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	CHRNA4	P43681	627 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	EPHA4	P54764	986 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	OR1D5	P58170	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	B4GALNT1	Q00973	533 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	SQSTM1	Q13501	440 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	C4orf22	Q6V702	233 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TTC30B	Q8N4P2	665 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	OR4D9	Q8NGE8	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.4	□□□□□ -0.26
SFXN4-208	ENST00000490417	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.4	□□□□□ -0.26

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