RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
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NISCH-212ENST00000488380 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
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NISCH-212ENST00000488380 CDH17Q12864 832 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 CTF1Q16619 201 aa13.36□□□□□ -0.27
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NISCH-212ENST00000488380 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
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NISCH-212ENST00000488380 OR10T2Q8NGX3 314 aa13.36□□□□□ -0.27
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NISCH-212ENST00000488380 PHC1P78364 1004 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 VAC14Q08AM6 782 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 ADPRMQ3LIE5 342 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 UGT3A2Q3SY77 523 aa13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
NISCH-212ENST00000488380 STON2Q8WXE9 905 aa13.36□□□□□ -0.27
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