RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487547.1

USP34-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, humanhuman

TSL 3

Gene USP34, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34-216ENST00000487547 NR2F2P24468 414 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ACADLP28330 430 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 DCAF7P61962 342 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 COG7P83436 770 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ACVR2BQ13705 512 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PMS2CLQ68D20 193 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TPRG1Q6ZUI0 275 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 USP43Q70EL4 1123 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SLC26A9Q7LBE3 791 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CTAGE4Q8IX94 777 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PHF21AQ96BD5 680 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SKA1Q96BD8 255 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZNF583Q96ND8 569 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ITPAQ9BY32 194 aa5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 A0A1W2PP11 408 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 OGG1O15527 345 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PDE9AO76083 593 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 IGHV4-39P01824 125 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PRSS1P07477 247 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SRPRAP08240 638 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 MARK3P27448 753 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 GPR143P51810 404 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CCDC30Q5VVM6 783 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 C4orf50Q6ZRC1 276 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ZNF329Q86UD4 541 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 LRRC8CQ8TDW0 803 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SLC44A1Q8WWI5 657 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 LINGO1Q96FE5 620 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 OR2A14Q96R47 310 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SDF2L1Q9HCN8 221 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TAAR2Q9P1P5 351 aa5.73□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 A0A087WYN8 130 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 GRID2O43424 1007 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CSF2RAP15509 400 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 PAX1P15863 534 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 MSH2P43246 934 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 CCDC6Q16204 474 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 SIRPB2Q5JXA9 342 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAM180BQ6P0A1 224 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 OR52I2Q8NH67 350 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 TIGD1Q96MW7 591 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 DUX3Q96PT4 197 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 NENFQ9UMX5 172 aa5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
USP34-216ENST00000487547 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZBED4O75132 1171 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CAVIN2O95810 425 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CDKN1AP38936 164 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CAMPP49913 170 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CDH8P55286 799 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 IKQ13123 557 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MVPQ14764 893 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 Q75L30 129 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 MCEMP1Q8IX19 187 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ANKRD52Q8NB46 1076 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SLC24A4Q8NFF2 622 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 EVI5LQ96CN4 794 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 DACH2Q96NX9 599 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 OGFRQ9NZT2 677 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CMAHPQ9Y471 501 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 YIPF1Q9Y548 306 aa5.71□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 CDRT15L2A8MXV6 281 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 H0YIN7 160 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ZBTB43O43298 467 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SLC22A3O75751 556 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 RXRGP48443 463 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GAGE2BQ13066 116 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GAGE2EQ4V326 116 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 STXBP5Q5T5C0 1151 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GSG1LQ6UXU4 331 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 WDTC1Q8N5D0 677 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 GSDMBQ8TAX9 411 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ELMOD3Q96FG2 381 aa5.7□□□□□ -1.5
USP34-216ENST00000487547 ST6GAL2Q96JF0 529 aa5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms