RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DNMT3LQ9UJW3 386 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DNPEPQ9ULA0 475 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 AKT3Q9Y243 479 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RAP2CQ9Y3L5 183 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SNX5Q9Y5X3 404 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PEX16Q9Y5Y5 336 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.12□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DOCK1Q14185 1865 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 hCG_1818297A0A087WSY0 165 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GTW7 788 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 A0A1B0GVM2 712 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 AGAP5A6NIR3 686 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TSPY2A6NKD2 308 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 H0Y858 1186 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CBX4O00257 560 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 AIM2O14862 343 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PIP5K1CO60331 668 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CLEC3AO75596 197 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ALDH1A2O94788 518 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 IL18RAPO95256 599 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 VAPBO95292 243 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MED26O95402 600 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CFBP00751 764 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 KRT19P08727 400 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SLC2A3P11169 496 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CYP11B1P15538 503 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CYP2A7P20853 494 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CRHBPP24387 322 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 HLA-DMAP28067 261 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 LSSP48449 732 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MLLT10P55197 1068 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR2B6P58173 313 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ACTR2P61160 394 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PSME3P61289 254 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GBE1Q04446 702 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DNASE1L3Q13609 305 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TAB1Q15750 504 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FBXO43Q4G163 708 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CYBRD1Q53TN4 286 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MTX3Q5HYI7 312 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 COQ5Q5HYK3 327 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SULT1C3Q6IMI6 304 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 LCN8Q6JVE9 175 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GJB7Q6PEY0 223 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RANBP10Q6VN20 620 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DHFR2Q86XF0 187 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CCDC103Q8IW40 242 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 NXPE1Q8N323 547 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 POC5Q8NA72 575 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TRPV3Q8NET8 790 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FLCNQ8NFG4 579 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR5T2Q8NGG2 359 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 OR8K5Q8NH50 307 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ZFP90Q8TF47 636 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 FRS2Q8WU20 508 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 TSPEARQ8WU66 669 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SLC20A1Q8WUM9 679 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ATP6V1E2Q96A05 226 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 SLCO4A1Q96BD0 722 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 AP2M1Q96CW1 435 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 RTP4Q96DX8 246 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CDCA5Q96FF9 252 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 B3GALT6Q96L58 329 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CCDC140Q96MF4 163 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 CSF3RQ99062 836 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 C20orf27Q9GZN8 174 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 LHPPQ9H008 270 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ADNPQ9H2P0 1102 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 COG4Q9H9E3 785 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 C1orf112Q9NSG2 853 aa7.11□□□□□ -1.27
PKP4-211ENST00000481115 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
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