RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474831.5

LAMTOR4-208, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, human

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WASF3	Q9UPY6	502 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.74	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831		A6NCN8	305 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRR19	A6NJB7	356 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831		H7C0S8	307 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR1I1	O60431	355 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SNX2	O60749	519 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CKMT1A	P12532	417 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CKMT2	P17540	419 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	AKT1	P31749	480 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	INAVA	Q3KP66	663 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SNX20	Q7Z614	316 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GKN2	Q86XP6	184 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TRAPPC5	Q8IUR0	188 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NAGS	Q8N159	534 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CLDN19	Q8N6F1	224 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GPR156	Q8NFN8	814 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IFI44	Q8TCB0	444 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LKAAEAR1	Q8TD35	194 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRRC45	Q96CN5	670 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDC6	Q99741	560 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDC23	Q9UJX2	597 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KLK13	Q9UKR3	277 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC30A1	Q9Y6M5	507 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.73	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NEMP2	A6NFY4	417 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC188	H7C350	402 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	TPP1	O14773	563 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ADRB1	P08588	477 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ALPPL2	P10696	532 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ITGAL	P20701	1170 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACRV1	P26436	265 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HADHA	P40939	763 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NPY2R	P49146	381 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ITGA8	P53708	1063 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DHX9	Q08211	1270 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ITGA9	Q13797	1035 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NFE2L1	Q14494	772 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NR0B2	Q15466	257 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	INSC	Q1MX18	579 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF572	Q7Z3I7	529 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MCU	Q8NE86	351 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OR6P1	Q8NGX9	317 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DTX3L	Q8TDB6	740 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	KIFC1	Q9BW19	673 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC17A6	Q9P2U8	582 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PADI4	Q9UM07	663 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SOX13	Q9UN79	622 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	WDR37	Q9Y2I8	494 aa		13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	VEGFD	O43915	354 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RFPL3	O75679	317 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	POP7	O75817	140 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SEC31A	O94979	1220 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	BRAF	P15056	766 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	MSH3	P20585	1137 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ACP1	P24666	158 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PML	P29590	882 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CDK16	Q00536	496 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	PDE1B	Q01064	536 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SLC7A5	Q01650	507 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	CACNG1	Q06432	222 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	SKIDA1	Q1XH10	827 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZNF789	Q5FWF6	425 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
LAMTOR4-208	ENST00000474831	RAB44	Q7Z6P3	723 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21

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