RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466037.6

HOXB-AS3-204, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 522 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SFRP1Q8N474 314 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR13C4Q8NGS5 318 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SH3KBP1Q96B97 665 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ULK4Q96C45 1275 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCUN1D1Q96GG9 259 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C19orf43Q9BQ61 176 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FOXP3Q9BZS1 431 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ETNK1Q9HBU6 452 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNK4Q9NYG8 393 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SATB2Q9UPW6 733 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 APC2O95996 2303 aa19.5■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZFHX4Q86UP3 3567 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCDC187A0A096LP49 1063 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CASC3O15234 703 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPR39O43194 453 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPNE6O95741 557 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FASLGP48023 281 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B4GALNT1Q00973 533 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CDH17Q12864 832 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NFATC2Q13469 925 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LAMB3Q13751 1172 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NR1D2Q14995 579 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IYDQ6PHW0 289 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 C4orf22Q6V702 233 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRIM48Q8IWZ4 208 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PBKQ96KB5 322 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PRDM8Q9NQV8 689 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MYLKQ15746 1914 aa19.49■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZZEF1O43149 2961 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CFAP99D6REC4 459 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TAF4O00268 1085 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PPM1DO15297 605 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNJ13O60928 360 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 EML2O95834 649 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 APRTP07741 180 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 IDSP22304 550 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PHF19Q5T6S3 580 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 AMZ2Q86W34 360 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR10G6Q8NH81 332 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 FGF11Q92914 225 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DCBLD2Q96PD2 775 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 THSD1Q9NS62 852 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SLC23A2Q9UGH3 650 aa19.48■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SCN8AQ9UQD0 1980 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR2AG2A6NM03 316 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RRP8O43159 456 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 B4GAT1O43505 415 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 LDB2O43679 373 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ETS1P14921 441 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CCKBRP32239 447 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MC4RP32245 332 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HALP42357 657 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PDX1P52945 283 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 GPLD1P80108 840 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SEMA5AQ13591 1074 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SKIDA1Q1XH10 827 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TBC1D25Q3MII6 688 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 TMEM220Q6QAJ8 160 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 USP53Q70EK8 1073 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DET1Q7L5Y6 550 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 SNX20Q7Z614 316 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 ZNF547Q8IVP9 402 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 OR52K1Q8NGK4 314 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 STYXQ8WUJ0 223 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 HEXDCQ8WVB3 486 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DPYSL5Q9BPU6 564 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 KCNF1Q9H3M0 494 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 RDH14Q9HBH5 336 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CPNE7Q9UBL6 633 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa19.47■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 A6NCN8 305 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 PLD2O14939 933 aa19.46■□□□□ 0.71
HOXB-AS3-204ENST00000466037 DUX1O43812 170 aa19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms