RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 BRAFP15056 766 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KDELR1P24390 212 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 DLSTP36957 453 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 FANCCQ00597 558 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 IL11RAQ14626 422 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 INSCQ1MX18 579 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PDPK2PQ6A1A2 396 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ZNF547Q8IVP9 402 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PLD5Q8N7P1 536 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TIMM29Q9BSF4 260 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CEP41Q9BYV8 373 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SLC40A1Q9NP59 571 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RAD18Q9NS91 495 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 UVRAGQ9P2Y5 699 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa22.26■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 K7EM74 188 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 MTX2O75431 263 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KIAA0754O94854 1291 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 FURINP09958 794 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RPL10P27635 214 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LRRTM4Q86VH4 590 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TADA1Q96BN2 335 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PLAAQ9Y263 795 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ZNF711Q9Y462 761 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.25■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 OR52A4PA6NMU1 304 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 VEGFDO43915 354 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RASSF9O75901 435 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 NDUFA10O95299 355 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SLC4A1P02730 911 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 BPIP17213 487 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KLRB1Q12918 225 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ERV3-1Q14264 604 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 WASH2PQ6VEQ5 465 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PRSS42Q7Z5A4 293 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 NT5DC3Q86UY8 548 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RASGRP3Q8IV61 690 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KLHL6Q8WZ60 621 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RSC1A1Q92681 617 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ELMO2Q96JJ3 720 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 AGAP3Q96P47 875 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PACSIN1Q9BY11 444 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 GPR63Q9BZJ6 419 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 POT1Q9NUX5 634 aa22.24■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CDK14O94921 469 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 FGF5P12034 268 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 NR1D1P20393 614 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CAPZBP47756 277 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 DRG2P55039 364 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 UBASH3AP57075 661 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CDK18Q07002 472 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 AP1B1Q10567 949 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 GPR18Q14330 331 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 PCSK7Q16549 785 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 AGAP9Q5VTM2 703 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 C11orf96Q7Z7L8 435 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SLC25A51Q9H1U9 297 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 EPHA6Q9UF33 1036 aa22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 NOTCH2Q04721 2471 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LRRD1A4D1F6 860 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ZNF487B1APH4 448 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 AURKAO14965 403 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KATNA1O75449 491 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SPAG6O75602 509 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 GYPCP04921 128 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 H2AFZP0C0S5 128 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 IDSP22304 550 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SLC9A4Q6AI14 798 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 H2AFVQ71UI9 128 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 TMEM135Q86UB9 458 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SPATA22Q8NHS9 363 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 MIB2Q96AX9 1013 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 IQCDQ96DY2 449 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 ZDHHC12Q96GR4 267 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 CBX8Q9HC52 389 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 KCND3Q9UK17 655 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 POLHQ9Y253 713 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 WDR37Q9Y2I8 494 aa22.22■■□□□ 1.15
USP4-208ENST00000464168 SPO11Q9Y5K1 396 aa22.22■■□□□ 1.15
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