RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 MYEOVQ96EZ4 313 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF570Q96NI8 536 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SMC6Q96SB8 1091 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNK16Q96T55 309 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DDOQ99489 341 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 AIFM2Q9BRQ8 373 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NT5C3AQ9H0P0 336 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 MINDY3Q9H8M7 445 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SPG21Q9NZD8 308 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa4.65□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SHROOM2Q13796 1616 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM202A6NGA9 273 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP6CO00743 305 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 VCYO14598 125 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RRHO14718 337 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM20BO75063 409 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 MED24O75448 989 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TOMM70O94826 608 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GH1P01241 217 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 IFNB1P01574 187 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC192P0DO97 292 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TFPIP10646 304 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT13P13646 458 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 EPORP19235 508 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 BMP5P22003 454 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC16A2P36021 539 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 WNT5AP41221 380 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ACAA2P42765 397 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FASLGP48023 281 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNJ10P78508 379 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PPP2R2BQ00005 443 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 MTA1Q13330 715 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TRADDQ15628 312 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf68Q2NKX9 166 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KLHL26Q53HC5 615 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NCAPH2Q6IBW4 605 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NAPRTQ6XQN6 538 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ZER1Q7Z7L7 766 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SERPINA11Q86U17 422 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NSMAFQ92636 917 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PIGKQ92643 395 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KAT2AQ92830 837 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CRACR2AQ9BSW2 395 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 DPH5Q9H2P9 285 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CD320Q9NPF0 282 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKRD10Q9NXR5 420 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 EXTL2Q9UBQ6 330 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXL5Q9UKA1 691 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 EXOC7Q9UPT5 735 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 KIF3AQ9Y496 699 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 WNT6Q9Y6F9 365 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ADCY10Q96PN6 1610 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PBRM1Q86U86 1689 aa4.64□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GRIN2BQ13224 1484 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCC8Q09428 1581 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM8BA6NDV4 472 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CLDN4O14493 209 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SELENOFO60613 162 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CRCPO75575 148 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 NEURL1O76050 574 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 APBB3O95704 486 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 FGBP02675 491 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ETS1P14921 441 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ST6GAL1P15907 406 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 AHCYP23526 432 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGB8P26012 769 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00310P59036 64 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PTENP60484 403 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 PKP1Q13835 747 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 GAMTQ14353 236 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 SIGIRRQ6IA17 410 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 ISLR2Q6UXK2 745 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TRILQ7L0X0 811 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM110Q86TL2 294 aa4.63□□□□□ -1.67
CBX1P4-201ENST00000439415 TLK2Q86UE8 772 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms