RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000369864.4

AMIGO1-202, Transcript of adhesion molecule with Ig like domain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene AMIGO1, Length 5,088 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMIGO1-202ENST00000369864 FPGTO14772 594 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TIGD6Q17RP2 521 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 SYCE2Q6PIF2 218 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 USP30Q70CQ3 517 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 EHD1Q9H4M9 534 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 UCKL1Q9NWZ5 548 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TMEM9Q9P0T7 183 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CFL2Q9Y281 166 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 PKMP14618 531 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 MNDAP41218 407 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 PPP2R2BQ00005 443 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TUBA3CQ13748 450 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 FBXO48Q5FWF7 155 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM171A1Q5VUB5 890 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 AKT1S1Q96B36 256 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 LYPLA2O95372 231 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TAS2R41P59536 307 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ART5Q96L15 291 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 MALT1Q9UDY8 824 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A0G2JPF8 293 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TOP3BO95985 862 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TUFMP49411 452 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 RBM12BQ8IXT5 1001 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 RBFAQ8N0V3 343 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 MPP5Q8N3R9 675 aa18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 KLF11O14901 512 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 PFKPQ01813 784 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 FCRL4Q96PJ5 515 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 GBA3Q9H227 469 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 I3L521 148 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 PCDH8O95206 1070 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 DCDC1P59894 354 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 PEX5LQ8IYB4 626 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF567Q8N184 647 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CLIP4Q8N3C7 705 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TP53INP1Q96A56 240 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 OR52B2Q96RD2 323 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TM6SF2Q9BZW4 377 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 IPPKQ9H8X2 491 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 AMBNQ9NP70 447 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 OR14I1A6ND48 311 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC15A1P46059 708 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 RORCP51449 518 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 MTPNP58546 118 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 SWI5Q1ZZU3 235 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 GPR153Q6NV75 609 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 C11orf65Q8NCR3 313 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 FAM198AQ9UFP1 575 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF536O15090 1300 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 A0A0X1KG70 313 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CLDN5O00501 218 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 B4GALT5O43286 388 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 RPP40O75818 363 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CDH12P55289 794 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 DNASE1L3Q13609 305 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 NSMCE3Q96MG7 304 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 HBEGFQ99075 208 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TAS2R7Q9NYW3 318 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TESMINQ9Y4I5 508 aa18.43■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 WNT10BO00744 389 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 IFNW1P05000 195 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CD83Q01151 205 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 TPRG1LQ5T0D9 272 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 GALNT12Q8IXK2 581 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 NAT8LQ8N9F0 302 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 DUSP16Q9BY84 665 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF358Q9NW07 568 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 COMMD3Q9UBI1 195 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 GIT1Q9Y2X7 761 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ATRNO75882 1429 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 HOXA2O43364 376 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 HIST1H2ABP04908 130 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 NMBRP28336 390 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 ZNF460Q14592 562 aa18.42■□□□□ 0.54
AMIGO1-202ENST00000369864 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms