RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366955.7

CENPF-201, Transcript of centromere protein F, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CENPF, Length 10,307 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPF-201ENST00000366955 RNF19AQ9NV58 838 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 EVLQ9UI08 416 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC22A14Q9Y267 594 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CDC7O00311 574 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RARAP10276 462 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 COX6B1P14854 86 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CXCR1P25024 350 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TAF10Q12962 218 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CLCA4Q14CN2 919 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PON2Q15165 354 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ALG10Q5BKT4 473 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SDHAF4Q5VUM1 108 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC5A5Q92911 643 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 KAT5Q92993 513 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PPCSQ9HAB8 311 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 NANSQ9NR45 359 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ACOT9Q9Y305 439 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PIAS3Q9Y6X2 628 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 LRRC37A3O60309 1634 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 FAM86C2PA6NEL3 165 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC38A8A6NNN8 435 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 B4GAT1O43505 415 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RENP00797 406 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PKMP14618 531 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 STAT5AP42229 794 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 GJA8P48165 433 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ITGA1P56199 1179 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 TRAF2Q12933 501 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RUNX3Q13761 415 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARMCX4Q5H9R4 360 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RFX8Q6ZV50 586 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SYVN1Q86TM6 617 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARMC8Q8IUR7 673 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PIK3C3Q8NEB9 887 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SLC35G2Q8TBE7 412 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 KCNF1Q9H3M0 494 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 PIF1Q9H611 641 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 WDR26Q9H7D7 661 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 SEC61A2Q9H9S3 476 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 EFCAB1Q9HAE3 211 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 RAB9BQ9NP90 201 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 CPQQ9Y646 472 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPF-201ENST00000366955 AGPSO00116 658 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NR5A2O00482 541 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NTRK1P04629 796 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF35P13682 527 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FLYWCH1Q4VC44 716 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SPANXN2Q5MJ10 180 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 AMZ2Q86W34 360 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 DHRSXQ8N5I4 330 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CHST4Q8NCG5 386 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NAXEQ8NCW5 288 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MYO19Q96H55 970 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NSL1Q96IY1 281 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MRIQ9BWK5 157 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SMURF2Q9HAU4 748 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SCML1Q9UN30 329 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 Q9Y3F1 56 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CACNA1SQ13698 1873 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SH3D21A4FU49 640 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NPC1O15118 1278 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CCNA2P20248 432 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MYL9P24844 172 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 UCNP55089 124 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 VBP1P61758 197 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SPANXN3Q5MJ09 141 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 LINC00301Q8NCQ3 95 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 NXPE2Q96DL1 559 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CSPG4P5Q96PW8 444 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 MAP3K14Q99558 947 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OSBPL3Q9H4L5 887 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 GMIPQ9P107 970 aa4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 OR5K4A6NMS3 321 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 HEPACAM2A8MVW5 462 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FTCDNL1E5RQL4 147 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 TSPAN9O75954 239 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 IL6P05231 212 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 ATP6V1B2P21281 511 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 S100A7P31151 101 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 CNR2P34972 360 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPF-201ENST00000366955 FOLR3P41439 243 aa4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms