RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CCDC58Q4VC31 144 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 STEAP3Q658P3 488 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 STRADAQ7RTN6 431 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CCDC126Q96EE4 140 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ZNF560Q96MR9 790 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD12Q6UB98 2062 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DNAJB5O75953 348 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SLC1A2P43004 574 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 IST1P53990 364 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 LILRA4P59901 499 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SYPL2Q5VXT5 272 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DESI1Q6ICB0 168 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 HFE2Q6ZVN8 426 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 KIFC1Q9BW19 673 aa16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 RAD51BO15315 384 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NOBOXO60393 691 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 LRIG2O94898 1065 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CDH13P55290 713 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 FOXM1Q08050 763 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CDH17Q12864 832 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 WSCD1Q658N2 575 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NEK10Q6ZWH5 1172 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 P2RY8Q86VZ1 359 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MBOAT4Q96T53 435 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MED10Q9BTT4 135 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SMOC2Q9H3U7 446 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NUP205Q92621 2012 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ISPDA4D126 451 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 UBXN8O00124 270 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 KMOO15229 486 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SCO2O43819 266 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CCNKO75909 580 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 NOS2P35228 1153 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CASP2P42575 452 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MATKP42679 507 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PSEN2P49810 448 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DGCR6Q14129 220 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 POU6F1Q14863 301 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 RPS6KA2Q15349 733 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CRY1Q16526 586 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 FAM110CQ1W6H9 321 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 RIMKLAQ8IXN7 391 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ATL1Q8WXF7 558 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 M0QYT0 321 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 XPNPEP2O43895 674 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 KRT8P05787 483 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PRKCAP17252 672 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD34AQ69YU3 496 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CNTN4Q8IWV2 1026 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PEX5LQ8IYB4 626 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 HS3ST5Q8IZT8 346 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SIX5Q8N196 739 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 RORBQ92753 470 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 BCL7BQ9BQE9 202 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 OR2B2Q9GZK3 357 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SLAMF8Q9P0V8 285 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SYCE1LA8MT33 242 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PIP5K1BO14986 540 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CPB1P15086 417 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ARNTP27540 789 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 TGFBR1P36897 503 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MAP3K7CLP57077 242 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 SV2CQ496J9 727 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CCDC103Q8IW40 242 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 GRK3P35626 688 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 ACADSBP45954 432 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 MAP2K4P45985 399 aa16.65■□□□□ 0.26
GDE1-201ENST00000353258 CLK3P49761 638 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms