RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 IL2P60568 153 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 PTPRRQ15256 657 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 BORAQ6PGQ7 559 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 EPHX4Q8IUS5 362 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 PACRGLQ8N7B6 248 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 MFSD2AQ8NA29 543 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 CD99L2Q8TCZ2 262 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 LINGO1Q96FE5 620 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 SLC45A3Q96JT2 553 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 EFHD1Q9BUP0 239 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 ANKRD60Q9BZ19 345 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 MAGEE1Q9HCI5 957 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 ZIM2Q9NZV7 527 aa13.65□□□□□ -0.22
ATG4C-201ENST00000317868 KIF3CO14782 793 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 SNAP91O60641 907 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 OR6B1O95007 311 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CLPTM1O96005 669 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 C1RP00736 705 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CHRM3P20309 590 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HOXD10P28358 340 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HMGCLP35914 325 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 POLE2P56282 527 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NME5P56597 212 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ERVK-8P63133 956 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 LSAMPQ13449 338 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TGFBIQ15582 683 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 GEN1Q17RS7 908 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 SBSNQ6UWP8 590 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 STK40Q8N2I9 435 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 OR56A4Q8NGH8 313 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 DHRS7Q9Y394 339 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF711Q9Y462 761 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PFDN6O15212 129 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PRAMEF12O95522 483 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 APLP1P51693 650 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CACNG1Q06432 222 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 Q6ZNB5 142 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 RNF165Q6ZSG1 346 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 C16orf59Q7L2K0 433 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CPNE9Q8IYJ1 553 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ADGRG5Q8IZF4 528 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TMEM199Q8N511 208 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ZNF461Q8TAF7 563 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NACA2Q9H009 215 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HEBP1Q9NRV9 189 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 SNX13Q9Y5W8 968 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PTPRSQ13332 1948 aa13.64□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 STX7O15400 261 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 OLFM2O95897 454 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PSMC3P17980 439 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 IL12AP29459 219 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PPP3CCP48454 512 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PRKCQQ04759 706 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NRF1Q16656 503 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NADK2Q4G0N4 442 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PAGE3Q5JUK9 113 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TPGS2Q68CL5 300 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 Q6ZSR9 355 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 GPSM1Q86YR5 675 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PDPRQ8NCN5 879 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PIH1D2Q8WWB5 315 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 IGSF21Q96ID5 467 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HGH1Q9BTY7 390 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM15Q9C019 465 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TRIM4Q9C037 500 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 MUC3BQ9H195 1237 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 BPIFA1Q9NP55 256 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 YIPF1Q9Y548 306 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 C9JVG2 144 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 SOCS2O14508 198 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ARPC2O15144 300 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 TIPRLO75663 272 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 NPPAP01160 153 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 ERVPABLB-1P60509 514 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 CDKN3Q16667 212 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 C11orf91Q3C1V1 193 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 LINGO4Q6UY18 593 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 AMIGO2Q86SJ2 522 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 KIAA2013Q8IYS2 634 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 DPP10Q8N608 796 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 FEM1AQ9BSK4 669 aa13.63□□□□□ -0.23
ATG4C-201ENST00000317868 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms