RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fbxo32Q9CPU7 355 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cmc1Q9CPZ8 106 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ola1Q9CZ30 396 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dhx34Q9DBV3 1145 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rgs20Q9QZB1 239 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SqorQ9R112 450 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl9-ps6A0A140T8T4 192 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Lgr4A2ARI4 951 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kifc3O35231 824 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gli1P47806 1111 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rpl9P51410 192 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smpdl3bP58242 456 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aqp1Q02013 269 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc61Q3UJV1 511 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 HadhQ61425 314 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adamts16Q69Z28 1222 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 4921511C20RikQ8BVT7 469 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cstf2tQ8C7E9 632 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q8CDN1 933 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn1r198Q8R263 300 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nudt14Q9D142 222 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ribc2Q9D4Q1 309 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scube2Q9JJS0 997 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Epm2aQ9WUA5 330 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Katna1Q9WV86 491 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mad2l1Q9Z1B5 205 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Krt6bQ9Z331 562 aa21.68■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nsmce4aG3XA30 381 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm21738J3QP72 227 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 ClockO08785 855 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 WarsP32921 481 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Traf2P39429 501 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Eci1P42125 289 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tnfsf4P43488 198 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbtb2Q3V3W4 514 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Kansl1lQ5DTI6 991 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inppl1Q6P549 1257 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbms3Q8BWL5 431 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mtg1Q8R2R6 326 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hdac11Q91WA3 347 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hnrnpa0Q9CX86 305 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Duoxa2Q9D311 320 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 S100pbpQ9D5K4 396 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Capn5O08688 640 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Polr2jO08740 117 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sult2b1O35400 338 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MaffO54791 156 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inpp1P49442 396 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc30a3P97441 388 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prss53Q571E5 552 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr325Q5NCD2 326 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Adam2Q60718 735 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cpa4Q6P8K8 420 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppp1r1cQ8BKK4 108 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Stk-ps2Q8C0V7 499 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mcoln3Q8R4F0 553 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr1352Q8VGX5 309 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usb1Q91W78 267 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Oas1cQ924S2 362 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Snx2Q9CWK8 519 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ninj2Q9JL89 143 aa21.67■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Prr14lE9Q7C4 1971 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ighv11-2A0A075B5R8 117 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Klhl4B1AZR0 717 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm5483B2RV77 97 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hes2O54792 157 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 P01810 119 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fv4P11370 679 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ca8P28651 291 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 RxraP28700 467 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Inf2Q0GNC1 1273 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fpr-rs6Q3SXG2 339 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem173Q3TBT3 378 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sppl2bQ3TD49 578 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ppm1hQ3UYC0 513 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Usp22Q5DU02 525 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc6a4Q60857 630 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cyp4b1Q64462 511 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slain1Q68FF7 579 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rps9Q6ZWN5 194 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Olfr297Q7TS07 310 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Zbtb33Q8BN78 671 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Metap1Q8BP48 386 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fastkd3Q8BSN9 661 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PxnQ8VI36 591 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Scd3Q99PL7 359 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atad1Q9D5T0 361 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Nipa2Q9JJC8 359 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DnpepQ9Z2W0 473 aa21.66■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem45a2B7ZWJ5 289 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dthd1E9PZX1 795 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 C6E9Q6D8 931 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm8334F7CD45 553 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r10K7N621 847 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ring1O35730 406 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc2a4P14142 509 aa21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Anxa6P14824 673 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gabrr2P56476 465 aa21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.1 ms