RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CryaaP24622 196 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp17a1P27786 507 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ybx1P62960 322 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ikzf1Q03267 517 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cd244Q07763 397 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc45a4Q0P5V9 785 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf800Q0VEE6 662 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp560Q3URI6 754 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Magee1Q6PCZ4 918 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam107aQ78TU8 144 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Casd1Q7TN73 797 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmem214Q8BM55 687 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kyat1Q8BTY1 424 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Camk1dQ8BW96 385 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Osbpl6Q8BXR9 959 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TpbglQ8C013 384 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc35e2Q8C811 405 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ca12Q8CI85 354 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AasdhpptQ9CQF6 309 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Bpifa3Q9D9J8 232 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Capn10Q9ESK3 666 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dclre1aQ9JIC3 1026 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nectin1Q9JKF6 515 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AicdaQ9WVE0 198 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ap4s1Q9WVL1 144 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Umodl1Q5DID3 1319 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 KcpQ3U492 1550 aa10.14□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam43bA2AM80 330 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cylc2B1AWN8 422 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13285B1AYI3 182 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13275B1AYI8 182 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Galntl6E5D8G1 601 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acbd4E9Q289 327 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Smad6O35182 495 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 E2f3O35261 457 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hoxd13P70217 339 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctps1P70698 591 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gjb5Q02739 271 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cpne9Q1RLL3 553 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Coq10bQ3THF9 240 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Micall2Q3TN34 1009 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CenplQ3U3S3 329 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Esrp1Q3US41 680 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zzz3Q6KAQ7 910 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Taf1cQ6PDZ2 836 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 IfnzQ8BQT1 182 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm13278Q8CD73 182 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1311Q8VET0 312 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr478Q8VG04 314 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Olfr1019Q8VGS3 310 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Spg21Q9CQC8 308 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hormad1Q9D5T7 392 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tor1bQ9ER41 336 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kcne5Q9QZ26 143 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itgb1bp2Q9R000 350 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tagln3Q9R1Q8 199 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BC025446A0A087WQT1 134 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gbp11A9YVJ5 442 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r73D3Z7M3 851 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt90E9Q1Z0 538 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r111K7N674 857 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tnfaip1O70479 316 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Btg4O70552 250 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ctla2bP12400 113 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 WasP70315 520 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q14AM7 275 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nt5c3bQ3UFY7 300 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 BtrcQ3ULA2 605 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam71bQ5STT6 665 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Colgalt2Q6NVG7 625 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Scube1Q6NZL8 1018 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ints6Q6PCM2 883 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SvoplQ6PDF3 494 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kirrel2Q7TSU7 700 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam83eQ80XS7 481 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itln1bQ80ZA0 313 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sema3dQ8BH34 777 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc9a7Q8BLV3 726 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cers6Q8C172 384 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aqp12Q8CHJ2 290 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Unc5aQ8K1S4 898 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf668Q8K2R5 619 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ndufs1Q91VD9 727 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 WwoxQ91WL8 414 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Def8Q99J78 448 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gmpr2Q99L27 348 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc9bQ9D6E4 239 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Upf1Q9EPU0 1124 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 ScelQ9EQG3 652 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps35Q9EQH3 796 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rgs20Q9QZB1 239 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ak1Q9R0Y5 194 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Carm1Q9WVG6 608 aa10.13□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm43518A0A0G2JGB6 165 aa10.12□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3147A0A0J9YU88 481 aa10.12□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm10424A0A0J9YVD0 481 aa10.12□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sppl2cA2A6C4 690 aa10.12□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gbp4A4UUI3 631 aa10.12□□□□□ -0.79
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc23lA6H6E9 458 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.7 ms