RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641928.1

MFSD8-255, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 4,083 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-255	ENST00000641928	TRAF7	Q6Q0C0	670 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	HSCB	Q8IWL3	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	GIPC2	Q8TF65	315 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	SCNN1A	P37088	669 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	PRSS12	P56730	875 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	KIF14	Q15058	1648 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	IQGAP2	Q13576	1575 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	MCM4	P33991	863 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	PDE3A	Q14432	1141 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MFSD8-255	ENST00000641928	HOXA2	O43364	376 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GUCA2A	Q02747	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM26D	Q5JW98	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TPM3	P06753	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	MPHOSPH9	Q99550	1183 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC66	A2RUB6	948 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	EMID1	Q96A84	441 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	BCL2L12	Q9HB09	334 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	USP47	Q96K76	1375 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	HR	O43593	1189 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ZBED2	Q9BTP6	218 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PRPF38B	Q5VTL8	546 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	FAM174A	Q8TBP5	190 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	L3MBTL2	Q969R5	705 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	STAC3	Q96MF2	364 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RRAGD	Q9NQL2	400 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	OTUD5	Q96G74	571 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	IGF1R	P08069	1367 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ARHGEF11	O15085	1522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SASS6	Q6UVJ0	657 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PPP1R9B	Q96SB3	815 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	UHRF1BP1L	A0JNW5	1464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SLK	Q9H2G2	1235 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	G3BP2	Q9UN86	482 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SYAP1	Q96A49	352 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PIK3CD	O00329	1044 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PDE6B	P35913	854 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GOLGA2	Q08379	1002 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	EPAS1	Q99814	870 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KIF3A	Q9Y496	699 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	TPD52L2	O43399	206 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	C8orf34	Q49A92	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	CRBN	Q96SW2	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	KLHL42	Q9P2K6	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	PARD3	Q8TEW0	1356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	RCCD1	A6NED2	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	SH3BP5	O60239	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MFSD8-255	ENST00000641928	GCGR	P47871	477 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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