RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620385.1

CTXN3-204, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CTXN3, Length 1,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-204ENST00000620385 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 GCGRP47871 477 aa11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 PLCB2Q00722 1185 aa11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 MSS51Q4VC12 460 aa11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa11.45□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 TRIM32Q13049 653 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.44□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 RICTORQ6R327 1708 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 CD109Q6YHK3 1445 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.43□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 HPS1Q92902 700 aa11.42□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 SENP2Q9HC62 589 aa11.42□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 CCER2I3L3R5 266 aa11.41□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 ABCA6Q8N139 1617 aa11.41□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 PTPRTO14522 1441 aa11.41□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 REREQ9P2R6 1566 aa11.41□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 KIF1BO60333 1816 aa11.4□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 A2MP01023 1474 aa11.4□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 DIP2BQ9P265 1576 aa11.4□□□□□ -0.58
CTXN3-204ENST00000620385 MADDQ8WXG6 1647 aa11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 PRAG1Q86YV5 1406 aa11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 IFT172Q9UG01 1749 aa11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 GPRASP1Q5JY77 1395 aa11.39□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 PHOX2BQ99453 314 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 USP47Q96K76 1375 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 CLTCL1P53675 1640 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 MYOM2P54296 1465 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 PLA2R1Q13018 1463 aa11.38□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 GNPATO15228 680 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 GPR37O15354 613 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 ANP32CO43423 234 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 MMP16P51512 607 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC7Q96M83 1385 aa11.37□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 IQGAP1P46940 1657 aa11.36□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.36□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 SULF1Q8IWU6 871 aa11.36□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 KIFC2Q96AC6 838 aa11.35□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 ADGRB3O60242 1522 aa11.34□□□□□ -0.59
CTXN3-204ENST00000620385 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 LORP23490 312 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 SKOR1P84550 965 aa11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 WASHC2AQ641Q2 1341 aa11.32□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 PIK3C2BO00750 1634 aa11.31□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 ABCC3O15438 1527 aa11.31□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 NBPF8Q3BBV2 869 aa11.31□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.31□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 Q3C1V9 767 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 GRIPAP1Q4V328 841 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 AGLP35573 1532 aa11.3□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 GMPRP36959 345 aa11.29□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 AFAP1Q8N556 730 aa11.29□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 PPLO60437 1756 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 MROH2AA6NES4 1674 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 SLC16A10Q8TF71 515 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa11.28□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 NRXN1Q9ULB1 1477 aa11.27□□□□□ -0.6
CTXN3-204ENST00000620385 LOC100996750A0A140TA64 210 aa11.27□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa11.27□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 SYNMO15061 1565 aa11.27□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 KIF7Q2M1P5 1343 aa11.27□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.26□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 FAM181BA6NEQ2 426 aa11.26□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 CCDC24Q8N4L8 307 aa11.26□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 CARD11Q9BXL7 1154 aa11.26□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 ALDH1A1P00352 501 aa11.25□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 BMP1P13497 986 aa11.25□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 WNT7BP56706 349 aa11.25□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa11.25□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-204ENST00000620385 DCAF11Q8TEB1 546 aa11.24□□□□□ -0.61
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