RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617806.4

BECN1-222, Transcript of beclin 1, human

TSL 5

Gene BECN1, Length 4,865 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BECN1-222	ENST00000617806	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF830	Q96NB3	372 aa	Predicted RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ATAD2	Q6PL18	1390 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806		F6X3S4	739 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806		H0YHG0	523 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.24	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	UBXN4	Q92575	508 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	TNNT1	P13805	278 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.23	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	SNX21	Q969T3	373 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	TTC22	Q5TAA0	569 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.22	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ABTB2	Q8N961	1025 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		13.21	□□□□□ -0.29
BECN1-222	ENST00000617806	KIF18A	Q8NI77	898 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SCAF11	Q99590	1463 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF692	Q9BU19	519 aa	Predicted RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	13.21	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SMC5	Q8IY18	1101 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	EMILIN1	Q9Y6C2	1016 aa		13.2	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	STX6	O43752	255 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	RPGRIP1L	Q68CZ1	1315 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	RAB11FIP3	O75154	756 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SDS	P20132	328 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	OFD1	O75665	1012 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	XBP1	P17861	261 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	CFAP100	Q494V2	611 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.19	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SPG7	Q9UQ90	795 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	KRT32	Q14532	448 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	BRMS1	Q9HCU9	246 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	ERLIN1	O75477	346 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	UVSSA	Q2YD98	709 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SLC52A1	Q9NWF4	448 aa		13.18	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	VPS37D	Q86XT2	251 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	FYB1	O15117	783 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	UBE2H	P62256	183 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	GJB2	P29033	226 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	TESK2	Q96S53	571 aa		13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	ANO10	Q9NW15	660 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	FAM83G	A6ND36	823 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	CDR1	P51861	262 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF165	P49910	485 aa		13.16	□□□□□ -0.3
BECN1-222	ENST00000617806	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3

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