RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601006.1

FSD1-208, Transcript of fibronectin type III and SPRY domain containing 1, human

TSL 3

Gene FSD1, Length 254 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FSD1-208	ENST00000601006	RAPGEF4	Q8WZA2	1011 aa		33.65	■■■□□ 2.98
FSD1-208	ENST00000601006	PANK3	Q9H999	370 aa		33.65	■■■□□ 2.98
FSD1-208	ENST00000601006	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	33.64	■■■□□ 2.98
FSD1-208	ENST00000601006	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		33.64	■■■□□ 2.98
FSD1-208	ENST00000601006	PPM1G	O15355	546 aa	Predicted RBP	33.63	■■■□□ 2.97
FSD1-208	ENST00000601006	ANKRD26	Q9UPS8	1709 aa		33.62	■■■□□ 2.97
FSD1-208	ENST00000601006	TAT	P17735	454 aa	Predicted RBP	33.61	■■■□□ 2.97
FSD1-208	ENST00000601006	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		33.6	■■■□□ 2.97
FSD1-208	ENST00000601006	POLK	Q9UBT6	870 aa		33.6	■■■□□ 2.97
FSD1-208	ENST00000601006	STK32B	Q9NY57	414 aa		33.59	■■■□□ 2.97
FSD1-208	ENST00000601006	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	33.57	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	SLC15A2	Q16348	729 aa		33.57	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	SPON1	Q9HCB6	807 aa		33.57	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	TNNT2	P45379	298 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	33.55	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	DOT1L	Q8TEK3	1739 aa		33.55	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	CASZ1	Q86V15	1759 aa		33.55	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	33.52	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	NCAPD2	Q15021	1401 aa		33.52	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	NSD2	O96028	1365 aa		33.51	■■■□□ 2.96
FSD1-208	ENST00000601006	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		33.51	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	PCDH11Y	Q9BZA8	1340 aa		33.51	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		33.5	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	EYA1	Q99502	592 aa		33.49	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	PAPPA	Q13219	1627 aa		33.49	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	SLC27A3	Q5K4L6	730 aa		33.48	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		33.46	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	CYP27B1	O15528	508 aa		33.45	■■■□□ 2.95
FSD1-208	ENST00000601006	ZBTB7A	O95365	584 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	MORC1	Q86VD1	984 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	33.44	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	PKD1L3	Q7Z443	1732 aa		33.44	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	LY75	O60449	1722 aa		33.42	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	ZNF827	Q17R98	1081 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	SPG7	Q9UQ90	795 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	33.39	■■■□□ 2.94
FSD1-208	ENST00000601006	KCNQ4	P56696	695 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	AKT1S1	Q96B36	256 aa		33.38	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	ATF5	Q9Y2D1	282 aa	Predicted RBP	33.38	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	PTGER2	P43116	358 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	MTFR1L	Q9H019	292 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	NKX1-1	Q15270	411 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	AMER1	Q5JTC6	1135 aa	Predicted RBP	33.35	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		33.34	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	33.34	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	IGSF1	Q8N6C5	1336 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FSD1-208	ENST00000601006	ITGB4	P16144	1822 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	QSER1	Q2KHR3	1735 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	PER1	O15534	1290 aa	Predicted RBP	33.29	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		33.29	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	PHKG2	P15735	406 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	PALLD	Q8WX93	1383 aa		33.26	■■■□□ 2.92
FSD1-208	ENST00000601006	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	PIGB	Q92521	554 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	33.25	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	33.21	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	PLEKHO1	Q53GL0	409 aa	Predicted RBP	33.2	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		33.2	■■■□□ 2.91
FSD1-208	ENST00000601006	IL13	P35225	146 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	C5	P01031	1676 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	MTHFS	P49914	203 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	ARX	Q96QS3	562 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	33.16	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	DCAF8L1	A6NGE4	600 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	SYT17	Q9BSW7	474 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FSD1-208	ENST00000601006	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		33.14	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	KDR	P35968	1356 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	COL23A1	Q86Y22	540 aa	Predicted RBP	33.13	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		33.13	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	DCAF5	Q96JK2	942 aa		33.12	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	MSH5	O43196	834 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	POLD1	P28340	1107 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	SIK1	P57059	783 aa		33.1	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	ATG3	Q9NT62	314 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	C4B	P0C0L5	1744 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FSD1-208	ENST00000601006	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
FSD1-208	ENST00000601006	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FSD1-208	ENST00000601006	MAP3K5	Q99683	1374 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FSD1-208	ENST00000601006	AK7	Q96M32	723 aa		33.05	■■■□□ 2.88
FSD1-208	ENST00000601006	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	33.04	■■■□□ 2.88
FSD1-208	ENST00000601006	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.9 ms