RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597316.1

TRPM4-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, humanhuman

TSL 3

Gene TRPM4, Length 780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM4-208ENST00000597316 KAT6BQ8WYB5 2073 aa24.68■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 FBLN1P23142 703 aa24.66■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 TONSLQ96HA7 1378 aa24.65■■□□□ 1.54
TRPM4-208ENST00000597316 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.63■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 MSH5O43196 834 aa24.63■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 TESK2Q96S53 571 aa24.63■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 CHD4Q14839 1912 aa24.63■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.62■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 NSD2O96028 1365 aa24.62■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 USP47Q96K76 1375 aa24.61■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 CGNL1Q0VF96 1302 aa24.61■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 GRIN3BO60391 1043 aa24.6■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 NBPF6Q5VWK0 638 aa24.6■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa24.6■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 NBPF4Q96M43 638 aa24.6■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
TRPM4-208ENST00000597316 MEGF6O75095 1541 aa24.57■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.57■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 RTL1A6NKG5 1358 aa24.56■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 QSER1Q2KHR3 1735 aa24.56■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 FYB1O15117 783 aa24.56■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 USHBP1Q8N6Y0 703 aa24.56■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 TATP17735 454 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 GGNBP2Q9H3C7 697 aa24.55■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.54■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 MSL1Q68DK7 614 aa24.53■■□□□ 1.52
TRPM4-208ENST00000597316 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.51■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 DOT1LQ8TEK3 1739 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 TMF1P82094 1093 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.5■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 LY75O60449 1722 aa24.49■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 INSRP06213 1382 aa24.48■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 PALLDQ8WX93 1383 aa24.47■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
TRPM4-208ENST00000597316 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa24.45■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 FLT4P35916 1363 aa24.44■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 CYP27B1O15528 508 aa24.44■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 SHANK3Q9BYB0 1731 aa24.44■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 KIF24Q5T7B8 1368 aa24.43■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 CDCA8Q53HL2 280 aa24.43■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 AK7Q96M32 723 aa24.43■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 RGPD2P0DJD1 1756 aa24.43■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
TRPM4-208ENST00000597316 PIGBQ92521 554 aa24.39■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 ATP10DQ9P241 1426 aa24.38■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 PHF14O94880 888 aa24.37■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 SPG7Q9UQ90 795 aa24.37■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa24.37■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.35■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 CARD14Q9BXL6 1004 aa24.35■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 NSD3Q9BZ95 1437 aa24.35■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 C5P01031 1676 aa24.34■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.34■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 SSFA2P28290 1259 aa24.34■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 SIK1P57059 783 aa24.34■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 IFFO2Q5TF58 517 aa24.33■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 SMIM5Q71RC9 77 aa24.33■■□□□ 1.49
TRPM4-208ENST00000597316 IGSF1Q8N6C5 1336 aa24.33■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP24.32■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 LINC00116Q8NCU8 138 aa24.31■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 TMOD3Q9NYL9 352 aa24.31■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 WASHC2AQ641Q2 1341 aa24.31■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 WWC3Q9ULE0 1092 aa24.3■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 CEP350Q5VT06 3117 aa24.3■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 EYA1Q99502 592 aa24.29■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 C4BP0C0L5 1744 aa24.29■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 ADCY9O60503 1353 aa24.29■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 ATP6V1AP38606 617 aa24.28■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 IFNL2Q8IZJ0 200 aa24.28■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 ASAP1Q9ULH1 1129 aa24.28■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 GNPATO15228 680 aa24.27■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 HSPA6P17066 643 aa24.27■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 NCAPD2Q15021 1401 aa24.27■■□□□ 1.48
TRPM4-208ENST00000597316 ITPK1Q13572 414 aa24.26■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 PHKG2P15735 406 aa24.25■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 TAF1LQ8IZX4 1826 aa24.25■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 ATG3Q9NT62 314 aa24.23■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 POLKQ9UBT6 870 aa24.23■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa24.22■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 MMP10P09238 476 aa24.22■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 KIF20BQ96Q89 1820 aa24.21■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.21■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 PKD1L3Q7Z443 1732 aa24.21■■□□□ 1.47
TRPM4-208ENST00000597316 ITGB4P16144 1822 aa24.2■■□□□ 1.46
TRPM4-208ENST00000597316 NLGN1Q8N2Q7 840 aa24.2■■□□□ 1.46
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