RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591041.5

CAPNS1-212, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-212ENST00000591041 KIAA0232Q92628 1395 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 LRP6O75581 1613 aa29.2■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 MS4A1P11836 297 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 CABLES1Q8TDN4 633 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 DLG5Q8TDM6 1919 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 NCAPD2Q15021 1401 aa29.19■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa29.18■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 MAP3K5Q99683 1374 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa29.17■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 NLRP2Q9NX02 1062 aa29.16■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 C1orf141Q5JVX7 400 aa29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP29.15■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP29.14■■■□□ 2.26
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF853P0CG23 659 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 TATP17735 454 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 USHBP1Q8N6Y0 703 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 AXIN2Q9Y2T1 843 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 COL18A1P39060 1754 aa29.13■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP29.12■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 RXRBP28702 533 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 RARSP54136 660 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 ALDH1L2Q3SY69 923 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 AKAP4Q5JQC9 854 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP4AQ9BY43 222 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 SPG7Q9UQ90 795 aa29.11■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 ABCA3Q99758 1704 aa29.1■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 CHRNA2Q15822 529 aa29.09■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 EVA1CP58658 441 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 PDE3AQ14432 1141 aa29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CAPNS1-212ENST00000591041 FAM83GA6ND36 823 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MCM10Q7L590 875 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 WDR17Q8IZU2 1322 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 LMO7Q8WWI1 1683 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RGPD5Q99666 1765 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 MBIPQ9NS73 344 aa29.07■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 KIF16BQ96L93 1317 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 CHL1O00533 1208 aa29.06■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 SMC4Q9NTJ3 1288 aa29.05■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 AAMPQ13685 434 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 DCTN1Q14203 1278 aa29.04■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 RGPD2P0DJD1 1756 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 CRB1P82279 1406 aa29.03■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
CAPNS1-212ENST00000591041 BCAR3O75815 825 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 TEFQ10587 303 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa29.01■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 AFF2P51816 1311 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 CCDC136Q96JN2 1154 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 CARD10Q9BWT7 1032 aa29■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP29■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 PLIN1O60240 522 aa28.99■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 LRRC37A3O60309 1634 aa28.98■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
CAPNS1-212ENST00000591041 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa28.95■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 VAMP4O75379 141 aa28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 IL17REQ8NFR9 667 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 EXOC6Q8TAG9 804 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 SSH1Q8WYL5 1049 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf37Q96NL8 207 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 CRBNQ96SW2 442 aa28.93■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 STRN4Q9NRL3 753 aa28.92■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa28.91■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 RNMTO43148 476 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 IL2RBP14784 551 aa28.9■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 BTG4Q9NY30 223 aa28.89■■■□□ 2.22
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.89■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.89■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.88■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 DCAF5Q96JK2 942 aa28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 HOXB7P09629 217 aa28.86■■■□□ 2.21
CAPNS1-212ENST00000591041 PHKG2P15735 406 aa28.86■■■□□ 2.21
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