RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574407.5

PHF23-210, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene PHF23, Length 497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-210ENST00000574407 CGNL1Q0VF96 1302 aa28.95■■■□□ 2.23
PHF23-210ENST00000574407 USHBP1Q8N6Y0 703 aa28.95■■■□□ 2.22
PHF23-210ENST00000574407 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa28.95■■■□□ 2.22
PHF23-210ENST00000574407 PKD1L3Q7Z443 1732 aa28.94■■■□□ 2.22
PHF23-210ENST00000574407 TXNRD1Q16881 649 aa28.94■■■□□ 2.22
PHF23-210ENST00000574407 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
PHF23-210ENST00000574407 LY75O60449 1722 aa28.93■■■□□ 2.22
PHF23-210ENST00000574407 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa28.88■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.88■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 ITGB4P16144 1822 aa28.87■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 NCAPD2Q15021 1401 aa28.87■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 PANK3Q9H999 370 aa28.86■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 QSER1Q2KHR3 1735 aa28.86■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP28.85■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 NSD2O96028 1365 aa28.85■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa28.84■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
PHF23-210ENST00000574407 POLKQ9UBT6 870 aa28.82■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 WASHC2AQ641Q2 1341 aa28.82■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 TATP17735 454 aaPredicted RBP28.81■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 STK32BQ9NY57 414 aa28.81■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 SLC15A2Q16348 729 aa28.79■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 SPON1Q9HCB6 807 aa28.78■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 LRRC4BQ9NT99 713 aa28.78■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa28.77■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa28.77■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 TAF1LQ8IZX4 1826 aa28.77■■■□□ 2.2
PHF23-210ENST00000574407 KIF7Q2M1P5 1343 aa28.75■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 C5P01031 1676 aa28.74■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 ZNF827Q17R98 1081 aa28.74■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 EYA1Q99502 592 aa28.74■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 CYP27B1O15528 508 aa28.72■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 ZBTB7AO95365 584 aa28.72■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP28.71■■■□□ 2.19
PHF23-210ENST00000574407 COL24A1Q17RW2 1714 aa28.69■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 KCNQ4P56696 695 aa28.69■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 SLC27A3Q5K4L6 730 aa28.69■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 AKT1S1Q96B36 256 aa28.66■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.66■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 PTGER2P43116 358 aa28.65■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 MORC1Q86VD1 984 aa28.65■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
PHF23-210ENST00000574407 IGSF1Q8N6C5 1336 aa28.64■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.63■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 MTFR1LQ9H019 292 aa28.62■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 SPG7Q9UQ90 795 aa28.62■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP28.6■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa28.6■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP28.6■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 PALLDQ8WX93 1383 aa28.6■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa28.6■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 SGIP1Q9BQI5 828 aa28.59■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 C4BP0C0L5 1744 aa28.59■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa28.59■■■□□ 2.17
PHF23-210ENST00000574407 UBR3Q6ZT12 1888 aa28.57■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 PHKG2P15735 406 aa28.56■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa28.54■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 IFNL2Q8IZJ0 200 aa28.53■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 PIGBQ92521 554 aa28.53■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 SCN11AQ9UI33 1791 aa28.52■■■□□ 2.16
PHF23-210ENST00000574407 AEBP1Q8IUX7 1158 aa28.51■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 UTRNP46939 3433 aa28.49■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 KDRP35968 1356 aa28.49■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 IL13P35225 146 aa28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP28.48■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 ZNF831Q5JPB2 1677 aa28.46■■■□□ 2.15
PHF23-210ENST00000574407 MTHFSP49914 203 aa28.45■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 ARXQ96QS3 562 aa28.45■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 SULT6B1Q6IMI4 303 aa28.44■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa28.44■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP28.43■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 SYT17Q9BSW7 474 aa28.43■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 ASAP1Q9ULH1 1129 aa28.43■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 MAP3K5Q99683 1374 aa28.42■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP28.41■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa28.41■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 SIK1P57059 783 aa28.41■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 AMOTQ4VCS5 1084 aa28.41■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 CHD4Q14839 1912 aa28.41■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 AMIGO3Q86WK7 504 aa28.39■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 DCAF5Q96JK2 942 aa28.39■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 ATG3Q9NT62 314 aa28.39■■■□□ 2.14
PHF23-210ENST00000574407 MSH5O43196 834 aa28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.7 ms