RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
CTU2-204ENST00000564105 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU2-204ENST00000564105 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.33■■□□□ 1.65
CTU2-204ENST00000564105 MEGF6O75095 1541 aa25.33■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 VPS72Q15906 364 aa25.32■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.32■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 APAF1O14727 1248 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP25.31■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 TCP11L2Q8N4U5 519 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 KAT6BQ8WYB5 2073 aa25.31■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 IL2RBP14784 551 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa25.27■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 TMPOP42166 694 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CTU2-204ENST00000564105 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 NEUROD2Q15784 382 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 DISP2A7MBM2 1401 aa25.26■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 NFE2L2Q16236 605 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 SEPT12Q8IYM1 358 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 SCN11AQ9UI33 1791 aa25.25■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 GAS2L2Q8NHY3 880 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 LRRC37A3O60309 1634 aa25.24■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 RIPK4P57078 832 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 BARGINQ6ZT62 677 aa25.22■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP25.22■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 NGEFQ8N5V2 710 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 SPG7Q9UQ90 795 aa25.21■■□□□ 1.63
CTU2-204ENST00000564105 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.18■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 CCDC125Q86Z20 511 aa25.17■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K5Q99683 1374 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 CCDC27Q2M243 656 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 TRIM35Q9UPQ4 493 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 TNS2Q63HR2 1409 aa25.16■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 ITGB4P16144 1822 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.15■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 GNAT3A8MTJ3 354 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 EXOC5O00471 708 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.14■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
CTU2-204ENST00000564105 KRT27Q7Z3Y8 459 aa25.14■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 WWC1Q8IX03 1113 aa25.14■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.14■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 DDB1Q16531 1140 aa25.13■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 CYP27B1O15528 508 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 PHKG2P15735 406 aa25.12■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 A0A0G2JS52 829 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 MYT1Q01538 1121 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 ZNF521Q96K83 1311 aa25.11■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 DCTN1Q14203 1278 aa25.1■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 DOT1LQ8TEK3 1739 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 MCM10Q7L590 875 aa25.09■■□□□ 1.61
CTU2-204ENST00000564105 SBF2Q86WG5 1849 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 DEFB132Q7Z7B7 95 aa25.07■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 WDR63Q8IWG1 891 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 IL17REQ8NFR9 667 aa25.06■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 LGR6Q9HBX8 967 aa25.05■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 GOLGA2Q08379 1002 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 FAM182BQ5T319 152 aa25.04■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 KDM3BQ7LBC6 1761 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 DCAF5Q96JK2 942 aa25.03■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 PDE3BQ13370 1112 aa25.02■■□□□ 1.6
CTU2-204ENST00000564105 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 IL16Q14005 1332 aa25.01■■□□□ 1.59
CTU2-204ENST00000564105 MRC1P22897 1456 aa25■■□□□ 1.59
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