RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 VPS8Q8N3P4 1428 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 A6NJR5 290 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 CFAP99D6REC4 459 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 WFS1O76024 890 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 TSC1Q92574 1164 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.2□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 UNC13AQ9UPW8 1703 aa7.19□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 SPTLC1O15269 473 aa7.19□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 TLL2Q9Y6L7 1015 aa7.19□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 MYBPC2Q14324 1141 aa7.18□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 NBPF1Q3BBV0 1214 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 MAP10Q9P2G4 905 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 CLIP1P30622 1438 aa7.17□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 CLUAP1Q96AJ1 413 aa7.16□□□□□ -1.26
CAPN3-211ENST00000562199 MTA3Q9BTC8 594 aa7.16□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 UBA5Q9GZZ9 404 aa7.15□□□□□ -1.26
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CAPN3-211ENST00000562199 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa7.14□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 ERICH3Q5RHP9 1530 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CAPN3-211ENST00000562199 MORC4Q8TE76 937 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 POLR3EQ9NVU0 708 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.13□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 CUX2O14529 1486 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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CAPN3-211ENST00000562199 FAM174AQ8TBP5 190 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 EVI5LQ96CN4 794 aa7.12□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
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CAPN3-211ENST00000562199 LCE2CQ5TA81 110 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 ZFP42Q96MM3 310 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa7.11□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 TOP2BQ02880 1626 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 CCER2I3L3R5 266 aa7.1□□□□□ -1.27
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CAPN3-211ENST00000562199 LILRB3O75022 631 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 VEGFBP49765 207 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.1□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 RRP9O43818 475 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 RAB11FIP3O75154 756 aa7.09□□□□□ -1.27
CAPN3-211ENST00000562199 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.09□□□□□ -1.27
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