RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa7.73□□□□□ -1.17
RRN3-204ENST00000561685 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
RRN3-204ENST00000561685 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.72□□□□□ -1.17
RRN3-204ENST00000561685 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
RRN3-204ENST00000561685 ITGA6P23229 1130 aa7.71□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 CEP126Q9P2H0 1117 aa7.71□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 MEN1O00255 615 aa7.69□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 TRAK2O60296 914 aa7.69□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 CLN3Q13286 438 aa7.69□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 IRF5Q13568 498 aa7.69□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 WASHC4Q2M389 1173 aa7.69□□□□□ -1.18
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RRN3-204ENST00000561685 MYCP01106 439 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 SCTRP47872 440 aa7.68□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 MCM6Q14566 821 aa7.68□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 NLRP3Q96P20 1036 aa7.68□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 OSBPL3Q9H4L5 887 aa7.68□□□□□ -1.18
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RRN3-204ENST00000561685 GDPD2Q9HCC8 539 aa7.67□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 CDC14CA4D256 554 aa7.66□□□□□ -1.18
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RRN3-204ENST00000561685 SLFNL1Q499Z3 407 aa7.66□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.66□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.66□□□□□ -1.18
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RRN3-204ENST00000561685 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RRN3-204ENST00000561685 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
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RRN3-204ENST00000561685 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa7.65□□□□□ -1.18
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RRN3-204ENST00000561685 PHTF2Q8N3S3 785 aa7.64□□□□□ -1.19
RRN3-204ENST00000561685 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
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RRN3-204ENST00000561685 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
RRN3-204ENST00000561685 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.63□□□□□ -1.19
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RRN3-204ENST00000561685 COG6Q9Y2V7 657 aa7.6□□□□□ -1.19
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RRN3-204ENST00000561685 SLURP2P0DP57 97 aa7.59□□□□□ -1.19
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RRN3-204ENST00000561685 FOXR1Q6PIV2 292 aa7.59□□□□□ -1.19
RRN3-204ENST00000561685 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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RRN3-204ENST00000561685 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 HRH3Q9Y5N1 445 aa7.58□□□□□ -1.2
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RRN3-204ENST00000561685 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa7.57□□□□□ -1.2
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RRN3-204ENST00000561685 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 ETNK1Q9HBU6 452 aa7.56□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 A0A1B0GTH6 734 aa7.55□□□□□ -1.2
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RRN3-204ENST00000561685 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 SVOPQ8N4V2 548 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 RHBDD1Q8TEB9 315 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 TRERF1Q96PN7 1200 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 MBIPQ9NS73 344 aa7.55□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 UBTFP17480 764 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 GAS6Q14393 721 aa7.54□□□□□ -1.2
RRN3-204ENST00000561685 TLR1Q15399 786 aa7.54□□□□□ -1.2
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