RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 SLC24A3Q9HC58 644 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 DEPDC5O75140 1603 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 MED14O60244 1454 aa7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 FAM187AA6NFU0 413 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 DGAT1O75907 488 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 MS4A1P11836 297 aa7.72□□□□□ -1.17
TMOD3-210ENST00000561408 SLC24A1O60721 1099 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PDE4DQ08499 809 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 TRIM32Q13049 653 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 EP400Q96L91 3159 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 JCADQ9P266 1359 aa7.71□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 RGS12O14924 1447 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 TBC1D2Q9BYX2 928 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 TNRQ92752 1358 aa7.7□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 UGGT1Q9NYU2 1555 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 BCANQ96GW7 911 aa7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 MYT1Q01538 1121 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 MTMR2Q13614 643 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 CYP4X1Q8N118 509 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PRXQ9BXM0 1461 aa7.68□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 TOR4AQ9NXH8 423 aa7.67□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 WNT7AO00755 349 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PRR7Q8TB68 274 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 AFF2P51816 1311 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 FAM135AQ9P2D6 1515 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PLXNC1O60486 1568 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 LRP5O75197 1615 aa7.66□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 SPDYE5A6NIY4 337 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 YY1P25490 414 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 GJA5P36382 358 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM94Q12767 1356 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF787Q6DD87 383 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PREX2Q70Z35 1606 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa7.65□□□□□ -1.18
TMOD3-210ENST00000561408 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SHPRHQ149N8 1683 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 A2MP01023 1474 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SPTLC1O15269 473 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 MRGPRX2Q96LB1 330 aa7.64□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K1Q13233 1512 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 WNT7BP56706 349 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SKOR1P84550 965 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 PTPRNQ16849 979 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 ATP7AQ04656 1500 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 MIA2Q96PC5 1412 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 ST8SIA5O15466 376 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 HRCP23327 699 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 LTKP29376 864 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 DESI1Q6ICB0 168 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 ZBTB3Q9H5J0 574 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SLAIN2Q9P270 581 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 KDM5DQ9BY66 1539 aa7.62□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 ADGBQ8N7X0 1667 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 AAASQ9NRG9 546 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 EVA1BQ9NVM1 165 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SYCP2Q9BX26 1530 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 PZPP20742 1482 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 NLRP1Q9C000 1473 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 UBR1Q8IWV7 1749 aa7.61□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP99D6REC4 459 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 KCNH2Q12809 1159 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 CABLES1Q8TDN4 633 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 C8orf37Q96NL8 207 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 UNC93B1Q9H1C4 597 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 J3QL48 77 aa7.59□□□□□ -1.19
TMOD3-210ENST00000561408 AVPP01185 164 aa7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms