RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560557.1

FAM227B-211, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM227B, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227B-211ENST00000560557 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.03□□□□□ -1.12
FAM227B-211ENST00000560557 SLC10A4Q96EP9 437 aa8.03□□□□□ -1.12
FAM227B-211ENST00000560557 RRAGCQ9HB90 399 aa8.03□□□□□ -1.12
FAM227B-211ENST00000560557 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 PLCB2Q00722 1185 aa8.02□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 TSC1Q92574 1164 aa8.02□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 BEGAINQ9BUH8 593 aa8.02□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.02□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 H7C1W4 665 aa8.01□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 ADD1P35611 737 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 MAP2K3P46734 347 aa8.01□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 LILRA1O75019 489 aa8□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 DYRK1BQ9Y463 629 aa8□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa7.99□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.98□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 EDARADDQ8WWZ3 215 aa7.98□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 ARTNQ5T4W7 220 aa7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 KLRG1Q96E93 195 aa7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 ZFP64Q9NPA5 681 aa7.97□□□□□ -1.13
FAM227B-211ENST00000560557 PDXDC2PQ6P474 469 aa7.96□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 RIC3Q7Z5B4 369 aa7.96□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 GNB5O14775 395 aa7.95□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.95□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 GDF2Q9UK05 429 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 QPCTQ16769 361 aa7.94□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 PIK3R2O00459 728 aa7.93□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 ZBTB33Q86T24 672 aa7.93□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.92□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 OCSTAMPQ9BR26 566 aa7.92□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 CFHR5Q9BXR6 569 aa7.92□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 THBS1P07996 1170 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 AMPD1P23109 780 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 GPC1P35052 558 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 RAB15P59190 212 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 POU4F2Q12837 409 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 AMHR2Q16671 573 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NBPF11Q86T75 865 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 LILRB3O75022 631 aa7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 GATA4P43694 442 aa7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NKAPLQ5M9Q1 402 aa7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
FAM227B-211ENST00000560557 DGKGP49619 791 aa7.89□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 NBPF20Q3BBV1 942 aa7.89□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 LIMD1Q9UGP4 676 aa7.89□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.88□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.88□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 LCE1DQ5T752 114 aa7.87□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 NBPF15Q8N660 670 aa7.87□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 BTBD6Q96KE9 485 aa7.87□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 MEN1O00255 615 aa7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 F11P03951 625 aa7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 TUSC1Q2TAM9 212 aa7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 ADAM32Q8TC27 787 aa7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 CYLDQ9NQC7 956 aa7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.86□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 DYRK3O43781 588 aa7.85□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 GGA1Q9UJY5 639 aa7.85□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.84□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 C2CD2LO14523 706 aa7.84□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 WDR44Q5JSH3 913 aa7.84□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 GRIP2Q9C0E4 1043 aa7.84□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 PHF24Q9UPV7 400 aa7.84□□□□□ -1.15
FAM227B-211ENST00000560557 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 A0A1W2PRU2 124 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 ESPNB1AK53 854 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 EPXP11678 715 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 PTK2Q05397 1052 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 TPSG1Q9NRR2 321 aa7.83□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 BMP4P12644 408 aa7.81□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 MYSM1Q5VVJ2 828 aa7.81□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 GPSM3Q9Y4H4 160 aa7.81□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 CTDSPL2Q05D32 466 aa7.8□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.8□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.8□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 LRP8Q14114 963 aa7.79□□□□□ -1.16
FAM227B-211ENST00000560557 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms