RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559850.5

RABGGTA-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNQ2O43526 872 aa20.28■□□□□ 0.84
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RABGGTA-211ENST00000559850 BCL9O00512 1426 aa20.27■□□□□ 0.83
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RABGGTA-211ENST00000559850 EYA1Q99502 592 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-211ENST00000559850 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-211ENST00000559850 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
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RABGGTA-211ENST00000559850 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.25■□□□□ 0.83
RABGGTA-211ENST00000559850 PKD1L3Q7Z443 1732 aa20.24■□□□□ 0.83
RABGGTA-211ENST00000559850 NCAPD2Q15021 1401 aa20.23■□□□□ 0.83
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RABGGTA-211ENST00000559850 PLSCR1O15162 318 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 ITGB4P16144 1822 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 IGSF1Q8N6C5 1336 aa20.17■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
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RABGGTA-211ENST00000559850 PROM2Q8N271 834 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa20.16■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 CYP27B1O15528 508 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa20.15■□□□□ 0.82
RABGGTA-211ENST00000559850 IL13P35225 146 aa20.14■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 TXNRD1Q16881 649 aa20.13■□□□□ 0.81
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RABGGTA-211ENST00000559850 LY75O60449 1722 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 SULT6B1Q6IMI4 303 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 SPG7Q9UQ90 795 aa20.11■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 NBPF14Q5TI25 921 aa20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 KCNQ4P56696 695 aa20.09■□□□□ 0.81
RABGGTA-211ENST00000559850 PAPPAQ13219 1627 aa20.08■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 HMOX1P09601 288 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 PHKG2P15735 406 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa20.07■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP20.06■□□□□ 0.8
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RABGGTA-211ENST00000559850 LRRC4BQ9NT99 713 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 CASZ1Q86V15 1759 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 KDRP35968 1356 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 LRP5O75197 1615 aa20.05■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
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RABGGTA-211ENST00000559850 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
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RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
RABGGTA-211ENST00000559850 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
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RABGGTA-211ENST00000559850 TAF1LQ8IZX4 1826 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-211ENST00000559850 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC15A2Q16348 729 aa20■□□□□ 0.79
RABGGTA-211ENST00000559850 ZNF827Q17R98 1081 aa20■□□□□ 0.79
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RABGGTA-211ENST00000559850 AMOTQ4VCS5 1084 aa19.99■□□□□ 0.79
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RABGGTA-211ENST00000559850 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
RABGGTA-211ENST00000559850 SLC27A3Q5K4L6 730 aa19.97■□□□□ 0.79
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RABGGTA-211ENST00000559850 C1orf141Q5JVX7 400 aa19.96■□□□□ 0.79
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RABGGTA-211ENST00000559850 QSER1Q2KHR3 1735 aa19.95■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 ZBTB7AO95365 584 aa19.94■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP19.94■□□□□ 0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 ATG3Q9NT62 314 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 C4BP0C0L5 1744 aa19.92■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 ERVV-2B6SEH9 535 aa19.91■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 CABP4P57796 275 aa19.91■□□□□ 0.78
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RABGGTA-211ENST00000559850 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP19.9■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.9■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
RABGGTA-211ENST00000559850 PRKAR2BP31323 418 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 PHACTR3Q96KR7 559 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 RSPH6AQ9H0K4 717 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 SPON1Q9HCB6 807 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.89■□□□□ 0.77
RABGGTA-211ENST00000559850 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa19.89■□□□□ 0.77
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