RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 SHANK2Q9UPX8 1470 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 ERICH4A6NGS2 130 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 CBX1P83916 185 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 DMTNQ08495 405 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 TMOD3Q9NYL9 352 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 PTPN23Q9H3S7 1636 aa7.52□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa7.51□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 IDI1Q13907 227 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 WASLO00401 505 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 ARHGEF10O15013 1369 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM107BQ9H098 131 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 SWAP70Q9UH65 585 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 CABP1Q9NZU7 370 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 CCDC181Q5TID7 509 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 NBPF3Q9H094 633 aa7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 TPM1P09493 284 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRB-210ENST00000551525 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 CDR1P51861 262 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 RIPK4P57078 832 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 MARCH6O60337 910 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 DDX11Q96FC9 970 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 RUFY1Q96T51 708 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 TAX1BP1Q86VP1 789 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRB-210ENST00000551525 HSCBQ8IWL3 235 aa7.47□□□□□ -1.21
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