RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550159.5

CS-218, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 646 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-218ENST00000550159 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 BCL9O00512 1426 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 GCP02774 474 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 APLP1P51693 650 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 SBF2Q86WG5 1849 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 AATKQ6ZMQ8 1374 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 ZNF827Q17R98 1081 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 SLC16A10Q8TF71 515 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 PRELPP51888 382 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 NUDCQ9Y266 331 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-218ENST00000550159 LMO7Q8WWI1 1683 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 USP19O94966 1318 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 LRRC37A3O60309 1634 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 EXOC5O00471 708 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 NEFMP07197 916 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 TNS4Q8IZW8 715 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 ACSBG1Q96GR2 724 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 KIF24Q5T7B8 1368 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 RTL1A6NKG5 1358 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 LRRC4BQ9NT99 713 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 PIK3C2AO00443 1686 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 KIF3CO14782 793 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP12.85□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 AKT1S1Q96B36 256 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 WDR17Q8IZU2 1322 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 ADCY9O60503 1353 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 FLT4P35916 1363 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 AXIN2Q9Y2T1 843 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-218ENST00000550159 SLC34A2O95436 690 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 PPP2R1AP30153 589 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 MTHFSP49914 203 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 ARHGEF25Q86VW2 580 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 IP6K1Q92551 441 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 CARD10Q9BWT7 1032 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 SLIT3O75094 1523 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 USP54Q70EL1 1684 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 MSH5O43196 834 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 MRS2Q9HD23 443 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 POLKQ9UBT6 870 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 MAP3K19Q56UN5 1328 aa12.81□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 PAPPAQ13219 1627 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 ABCC6O95255 1503 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 HOXC9P31274 260 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 SLC27A3Q5K4L6 730 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 PCNTO95613 3336 aa12.8□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 CCER2I3L3R5 266 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 TOMM70O94826 608 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 KLRG1Q96E93 195 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 NLRP2Q9NX02 1062 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 INSRP06213 1382 aa12.79□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 KCNQ4P56696 695 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 ANKRD24Q8TF21 1146 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 CD2APQ9Y5K6 639 aa12.78□□□□□ -0.36
CS-218ENST00000550159 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 HTRA3P83110 453 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 MSL1Q68DK7 614 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 JMYQ8N9B5 988 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 WWC3Q9ULE0 1092 aa12.77□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.76□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 TNS2Q63HR2 1409 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 NFAT5O94916 1531 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 LTN1O94822 1766 aa12.76□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 NHSQ6T4R5 1651 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa12.75□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP12.74□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 ERBB3P21860 1342 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 FBLN1P23142 703 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.73□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 WNK3Q9BYP7 1800 aa12.72□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 TATP17735 454 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP12.72□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 IL2RBP14784 551 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 MIER1Q8N108 512 aa12.71□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
CS-218ENST00000550159 BTAF1O14981 1849 aa12.71□□□□□ -0.38
CS-218ENST00000550159 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
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