RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	ARHGEF11	O15085	1522 aa		9.42	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TPM4	P67936	248 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ST5	P78524	1137 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TBC1D9	Q6ZT07	1266 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SMARCE1	Q969G3	411 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SYNJ2	O15056	1496 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SHROOM2	Q13796	1616 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PTPRC	P08575	1304 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	CEP135	Q66GS9	1140 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	RAI14	Q9P0K7	980 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		9.41	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	AP5Z1	O43299	807 aa		9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP6V1A	P38606	617 aa		9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PLA2G4A	P47712	749 aa		9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	ERO1A	Q96HE7	468 aa		9.4	□□□□□ -0.9
ZNF438-208	ENST00000538351	PLXNC1	O60486	1568 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC189	A1A4V9	331 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	MAP2K2	P36507	400 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	LRMP	Q12912	555 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	MAGEA9	P43362	315 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	GOLGA5	Q8TBA6	731 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		9.39	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	DISP1	Q96F81	1524 aa		9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP2R5A	Q15172	486 aa		9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	MCTP2	Q6DN12	878 aa		9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC186	Q7Z3E2	898 aa		9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	9.38	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	NUCB1	Q02818	461 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ST18	O60284	1047 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CLCN6	P51797	869 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF20	Q5VTR2	975 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	DRC7	Q8IY82	874 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CEP170	Q5SW79	1584 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	RPAIN	Q86UA6	219 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		9.37	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	SLU7	O95391	586 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	H2AFX	P16104	143 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	BIRC2	Q13490	618 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	NEUROD2	Q15784	382 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	AK7	Q96M32	723 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	DISP3	Q9P2K9	1392 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PKD2	Q13563	968 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ZKSCAN2	Q63HK3	967 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	SUGP1	Q8IWZ8	645 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CALR3	Q96L12	384 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	NUP160	Q12769	1436 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	LMAN1	P49257	510 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PPM1E	Q8WY54	764 aa		9.36	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ERCC6L	Q2NKX8	1250 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	USP48	Q86UV5	1035 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	JPH4	Q96JJ6	628 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	USP26	Q9BXU7	913 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ERBB3	P21860	1342 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PZP	P20742	1482 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	MX1	P20591	662 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	RGL3	Q3MIN7	710 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	KIAA0556	O60303	1618 aa		9.35	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	CDC45	O75419	566 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	BRD1	O95696	1058 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	PTPN14	Q15678	1187 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	TMCO3	Q6UWJ1	677 aa		9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	9.34	□□□□□ -0.91
ZNF438-208	ENST00000538351	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	9.34	□□□□□ -0.91

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms