RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 ERC2O15083 957 aa13.15□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP13.15□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 IFT57Q9NWB7 429 aa13.15□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 PNPLA6Q8IY17 1366 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 BRD1O95696 1058 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 FEZ1Q99689 392 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 TERF2IPQ9NYB0 399 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 TRAK1Q9UPV9 953 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 TULP4Q9NRJ4 1543 aa13.14□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ANAPC15P60006 121 aa13.13□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 AK9Q5TCS8 1911 aa13.13□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 CUL4AQ13619 759 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 SYCP1Q15431 976 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 PDCL2Q8N4E4 241 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 FAM135BQ49AJ0 1406 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 AGLP35573 1532 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 VAMP4O75379 141 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 CCDC183Q5T5S1 534 aa13.12□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 SSH2Q76I76 1423 aa13.11□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 SIRT2Q8IXJ6 389 aa13.11□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 TMEM87AQ8NBN3 555 aa13.11□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 NFE2L2Q16236 605 aa13.1□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa13.1□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.1□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa13.1□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 HMMRO75330 724 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 PKP1Q13835 747 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 RNF214Q8ND24 703 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 USP25Q9UHP3 1055 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PP64 1363 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 PIK3C2BO00750 1634 aa13.09□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 SDSP20132 328 aa13.08□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 IL17RAQ96F46 866 aa13.08□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 TMX3Q96JJ7 454 aa13.08□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 PRDM10Q9NQV6 1147 aa13.08□□□□□ -0.31
LMO3-215ENST00000537304 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.08□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 OSBPL3Q9H4L5 887 aa13.08□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 C1orf115Q9H7X2 142 aa13.08□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.08□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 KIF20BQ96Q89 1820 aa13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 VGFO15240 615 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 FAM193AP78312 1265 aa13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ANKRD7Q92527 254 aa13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.07□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ADCY5O95622 1261 aa13.06□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 MX1P20591 662 aa13.06□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 NEK4P51957 841 aa13.06□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 OGFRQ9NZT2 677 aa13.06□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 RTL1A6NKG5 1358 aa13.06□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 RGS12O14924 1447 aa13.06□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 KDM4AO75164 1064 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ZNF853P0CG23 659 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CBX1P83916 185 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 FGD1P98174 961 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 BCL2L12Q9HB09 334 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CTIFO43310 598 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 UBE2HP62256 183 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CREBRFQ8IUR6 639 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 PTPRCP08575 1304 aa13.05□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 PREX1Q8TCU6 1659 aa13.04□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 PRKAR2BP31323 418 aa13.04□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ARID3AQ99856 593 aa13.04□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 KNDC1Q76NI1 1749 aa13.04□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 ATP10DQ9P241 1426 aa13.04□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1524Q8TCG1 905 aa13.03□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 GGNBP2Q9H3C7 697 aa13.03□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 CCDC66A2RUB6 948 aa13.02□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 FYB1O15117 783 aa13.02□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.02□□□□□ -0.32
LMO3-215ENST00000537304 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
LMO3-215ENST00000537304 CEP85Q6P2H3 762 aa13.02□□□□□ -0.33
LMO3-215ENST00000537304 USP48Q86UV5 1035 aa13.02□□□□□ -0.33
LMO3-215ENST00000537304 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa13.01□□□□□ -0.33
LMO3-215ENST00000537304 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa13.01□□□□□ -0.33
LMO3-215ENST00000537304 CABP2Q9NPB3 220 aa13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.3 ms