RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 USHBP1Q8N6Y0 703 aa15.63■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 EP400Q96L91 3159 aa15.63■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOC5O00471 708 aa15.62■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 INSRP06213 1382 aa15.62■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 KIF24Q5T7B8 1368 aa15.62■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TRIM37O94972 964 aa15.61■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 DISP2A7MBM2 1401 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 POLKQ9UBT6 870 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TNS2Q63HR2 1409 aa15.6■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 BAG6P46379 1132 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF6Q5VWK0 638 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF4Q96M43 638 aa15.59■□□□□ 0.09
UBASH3B-208ENST00000533451 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 MEGF6O75095 1541 aa15.56■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 SBF2Q86WG5 1849 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 APBA3O96018 575 aa15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 TATP17735 454 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 ACSBG1Q96GR2 724 aa15.52■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 EYA1Q99502 592 aa15.52■□□□□ 0.08
UBASH3B-208ENST00000533451 MTHFSP49914 203 aa15.51■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SHANK3Q9BYB0 1731 aa15.5■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa15.49■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 DOT1LQ8TEK3 1739 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 NHSQ6T4R5 1651 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 AKT1S1Q96B36 256 aa15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNQ2O43526 872 aa15.47■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 SPG7Q9UQ90 795 aa15.47■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 PKD1L3Q7Z443 1732 aa15.46■□□□□ 0.07
UBASH3B-208ENST00000533451 IGSF1Q8N6C5 1336 aa15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 BTAF1O14981 1849 aa15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 BCL9O00512 1426 aa15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 AEBP1Q8IUX7 1158 aa15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 CFAP53Q96M91 514 aa15.45■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NCAPD2Q15021 1401 aa15.44■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SULT6B1Q6IMI4 303 aa15.44■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 CAMKK2Q96RR4 588 aa15.44■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.44■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 IL13P35225 146 aa15.43■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RREB1Q92766 1687 aa15.43■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NUP188Q5SRE5 1749 aa15.43■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa15.42■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 HMOX1P09601 288 aa15.42■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SPDYE2BA6NHP3 402 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 CYP27B1O15528 508 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SPDYE6P0CI01 402 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PPP2R1AP30153 589 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP15.41■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 NBPF14Q5TI25 921 aa15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
UBASH3B-208ENST00000533451 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 IFNL2Q8IZJ0 200 aa15.39■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ITGB4P16144 1822 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PLSCR1O15162 318 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TXNRD1Q16881 649 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf141Q5JVX7 400 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 NUDCQ9Y266 331 aa15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PHKG2P15735 406 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 AMOTQ4VCS5 1084 aa15.37■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 KDRP35968 1356 aa15.36■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 POTEHQ6S545 545 aa15.35■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 TMOD3Q9NYL9 352 aa15.35■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 RALBP1Q15311 655 aa15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa15.34■□□□□ 0.05
UBASH3B-208ENST00000533451 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP15.33■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 STK32BQ9NY57 414 aa15.33■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 KCNQ4P56696 695 aa15.32■□□□□ 0.04
UBASH3B-208ENST00000533451 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.4 ms