RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 UTRNP46939 3433 aa25.59■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 RTL1A6NKG5 1358 aa25.58■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 PTGER2P43116 358 aa25.58■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 AMPHP49418 695 aa25.58■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
PUF60-218ENST00000531995 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 LY75O60449 1722 aa25.57■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 QSER1Q2KHR3 1735 aa25.57■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 ZNF827Q17R98 1081 aa25.56■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 GGNBP2Q9H3C7 697 aa25.56■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 YY1P25490 414 aa25.55■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 LRRC4BQ9NT99 713 aa25.53■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 USHBP1Q8N6Y0 703 aa25.52■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 MTFR1LQ9H019 292 aa25.52■■□□□ 1.68
PUF60-218ENST00000531995 NSD2O96028 1365 aa25.51■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 DCAF8L1A6NGE4 600 aa25.5■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 CGNL1Q0VF96 1302 aa25.48■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 KCNQ4P56696 695 aa25.48■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa25.48■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 NBPF6Q5VWK0 638 aa25.47■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 NBPF4Q96M43 638 aa25.47■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.47■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa25.46■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
PUF60-218ENST00000531995 KNSTRNQ9Y448 316 aa25.45■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 C5P01031 1676 aa25.45■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 FLT4P35916 1363 aa25.44■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 COL24A1Q17RW2 1714 aa25.44■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 PKD1L3Q7Z443 1732 aa25.43■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 AKT1S1Q96B36 256 aa25.43■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa25.42■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 SLC27A3Q5K4L6 730 aa25.42■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 SYT17Q9BSW7 474 aa25.42■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 INSRP06213 1382 aa25.42■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.41■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa25.41■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 ITGB4P16144 1822 aa25.4■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 ARXQ96QS3 562 aa25.4■■□□□ 1.66
PUF60-218ENST00000531995 CHD4Q14839 1912 aa25.39■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 TAF1LQ8IZX4 1826 aa25.38■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.38■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 TATP17735 454 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 KLHL34Q8N239 644 aa25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.37■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 KIF24Q5T7B8 1368 aa25.36■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 MAP3K5Q99683 1374 aa25.35■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 MORC1Q86VD1 984 aa25.33■■□□□ 1.65
PUF60-218ENST00000531995 NCAPD2Q15021 1401 aa25.31■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 POLKQ9UBT6 870 aa25.31■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 POLD1P28340 1107 aa25.3■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 PALLDQ8WX93 1383 aa25.3■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 C4BP0C0L5 1744 aa25.29■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.29■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 CYP27B1O15528 508 aa25.28■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 MSH5O43196 834 aa25.28■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.27■■□□□ 1.64
PUF60-218ENST00000531995 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.26■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 MSL1Q68DK7 614 aa25.25■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 UBR3Q6ZT12 1888 aa25.25■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 NLGN2Q8NFZ4 835 aa25.23■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 GPR162Q16538 588 aa25.22■■□□□ 1.63
PUF60-218ENST00000531995 EYA1Q99502 592 aa25.19■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 SPG7Q9UQ90 795 aa25.17■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 MTHFSP49914 203 aa25.16■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 PIGBQ92521 554 aa25.16■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.15■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 AK7Q96M32 723 aa25.15■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 PHF14O94880 888 aa25.14■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 PPP2R1AP30153 589 aa25.14■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PUF60-218ENST00000531995 SMIM5Q71RC9 77 aa25.13■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 TMOD3Q9NYL9 352 aa25.12■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 PHKG2P15735 406 aa25.1■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.613e-12■□□□□ 11.3
PUF60-218ENST00000531995 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.1■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa25.08■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 SIK1P57059 783 aa25.08■■□□□ 1.61
PUF60-218ENST00000531995 IFNL2Q8IZJ0 200 aa25.08■■□□□ 1.61
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