RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 TMC1Q8TDI8 760 aa23.27■■□□□ 1.32
PACSIN3-206ENST00000530405 NSD2O96028 1365 aa23.27■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC12A5Q9H2X9 1139 aa23.26■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 TERF2IPQ9NYB0 399 aa23.25■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.24■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A1W2PP64 1363 aa23.23■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP10DQ9P241 1426 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 MSH5O43196 834 aa23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 USP47Q96K76 1375 aa23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 NEUROD1Q13562 356 aa23.19■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP3K19Q56UN5 1328 aa23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 HOXC9P31274 260 aa23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 MEGF6O75095 1541 aa23.18■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 CD2APQ9Y5K6 639 aa23.17■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 AMPHP49418 695 aa23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 COG3Q96JB2 828 aa23.15■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 CGNL1Q0VF96 1302 aa23.14■■□□□ 1.3
PACSIN3-206ENST00000530405 C5P01031 1676 aa23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 MSL1Q68DK7 614 aa23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 FLAD1Q8NFF5 587 aa23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 ADCY9O60503 1353 aa23.13■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 RTL1A6NKG5 1358 aa23.11■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 HSPA6P17066 643 aa23.1■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 FBLN1P23142 703 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 NBPF4Q96M43 638 aa23.09■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa23.08■■□□□ 1.29
PACSIN3-206ENST00000530405 PALLDQ8WX93 1383 aa23.06■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.05■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 TATP17735 454 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 USHBP1Q8N6Y0 703 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 C4BP0C0L5 1744 aa23.04■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 TESK2Q96S53 571 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 IGSF1Q8N6C5 1336 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa23.02■■□□□ 1.28
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC24A1O60721 1099 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 AK7Q96M32 723 aa23.01■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 UBR3Q6ZT12 1888 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 NSD3Q9BZ95 1437 aa23■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 ITGB4P16144 1822 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 INSRP06213 1382 aa22.99■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 FYB1O15117 783 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.98■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF3CO14782 793 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 CYP27B1O15528 508 aa22.97■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 GGNBP2Q9H3C7 697 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF24Q5T7B8 1368 aa22.96■■□□□ 1.27
PACSIN3-206ENST00000530405 PHF14O94880 888 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 SSFA2P28290 1259 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 FLT4P35916 1363 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa22.95■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 PKD1L3Q7Z443 1732 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 WWC3Q9ULE0 1092 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 PIGBQ92521 554 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 TONSLQ96HA7 1378 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 SMIM5Q71RC9 77 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 APLP1P51693 650 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 SIK1P57059 783 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-206ENST00000530405 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF20BQ96Q89 1820 aa22.89■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 NCAPD2Q15021 1401 aa22.88■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 TOMM70O94826 608 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 SPG7Q9UQ90 795 aa22.86■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 GNPATO15228 680 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa22.85■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 MMP10P09238 476 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 TGFB2P61812 414 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 TMOD3Q9NYL9 352 aa22.84■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 TMF1P82094 1093 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 ITPK1Q13572 414 aa22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
PACSIN3-206ENST00000530405 ATP6V1AP38606 617 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-206ENST00000530405 ASAP1Q9ULH1 1129 aa22.82■■□□□ 1.24
PACSIN3-206ENST00000530405 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
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